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Protein–RNA interactions for Protein: P42826
XKS1, Xylulose kinase, yeast
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
XKS1
P42826
COA1
YIL157C
594 nt
7.4
□□□□□ -1.22
XKS1
P42826
APE3
YBR286W
1614 nt
7.4
□□□□□ -1.22
XKS1
P42826
HEL1
YKR017C
1656 nt
7.4
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
YCR061W
YCR061W
1896 nt
7.39
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
SHM1
YBR263W
1473 nt
7.39
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
SRF1
YDL133W
1314 nt
7.39
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
SUP19
tS(UGA)E
82 nt
7.39
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
SUP17
tS(UGA)I
82 nt
7.39
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
SUP16
tS(UGA)P
82 nt
7.39
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
CTF18
YMR078C
2226 nt
7.39
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
PET112
YBL080C
1626 nt
7.38
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
PCL9
YDL179W
915 nt
7.38
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
GIR2
YDR152W
798 nt
7.38
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
DMA1
YHR115C
1251 nt
7.38
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
SFC1
YJR095W
969 nt
7.38
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
SPC42
YKL042W
1092 nt
7.38
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
PEX27
YOR193W
1131 nt
7.38
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
ISA2
YPR067W
558 nt
7.38
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
QNS1
YHR074W
2145 nt
7.37
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
ARH1
YDR376W
1482 nt
7.37
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
TFC6
YDR362C
2019 nt
7.37
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
ORC5
YNL261W
1440 nt
7.37
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
YHR022C
YHR022C
771 nt
7.37
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
PRM10
YJL108C
1152 nt
7.37
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
DSC2
YOL073C
969 nt
7.37
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
IES1
YFL013C
2079 nt
7.37
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
MCM3
YEL032W
2916 nt
7.37
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
AMD1
YML035C
2433 nt
7.37
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
GYP8
YFL027C
1494 nt
7.36
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
SPO77
YLR341W
1434 nt
7.36
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
YDR109C
YDR109C
2148 nt
7.36
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
tX(XXX)D
tX(XXX)D
100 nt
7.36
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
MSS116
YDR194C
1995 nt
7.35
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
SPT3
YDR392W
1014 nt
7.35
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
YEA6
YEL006W
1008 nt
7.35
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
YBR230W-A
YBR230W-A
201 nt
7.35
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
HAL5
YJL165C
2568 nt
7.35
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
DAL82
YNL314W
768 nt
7.34
□□□□□ -1.23
XKS1
P42826
CRP1
YHR146W
1398 nt
7.33
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
MPC54
YOR177C
1395 nt
7.33
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YAP1801
YHR161C
1914 nt
7.33
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YDR132C
YDR132C
1488 nt
7.33
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YDR278C
YDR278C
318 nt
7.33
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
RRP45
YDR280W
918 nt
7.33
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
RPT3
YDR394W
1287 nt
7.33
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
MRPL25
YGR076C
474 nt
7.33
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
DJP1
YIR004W
1299 nt
7.33
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YNL319W
YNL319W
441 nt
7.33
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
GAA1
YLR088W
1845 nt
7.33
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
VRP1
YLR337C
2454 nt
7.33
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
CLB5
YPR120C
1308 nt
7.32
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
VPS61
YDR136C
573 nt
7.32
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YPR1
YDR368W
939 nt
7.32
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YGL194C-A
YGL194C-A
243 nt
7.32
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
HAL1
YPR005C
885 nt
7.32
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
SLX1
YBR228W
915 nt
7.32
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
GIT1
YCR098C
1557 nt
7.32
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
FRS2
YFL022C
1512 nt
7.32
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
OPT1
YJL212C
2400 nt
7.31
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
TEP1
YNL128W
1305 nt
7.31
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YGL036W
YGL036W
2730 nt
7.31
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YDL158C
YDL158C
309 nt
7.31
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
SRG1
SRG1
551 nt
7.31
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YGR068W-A
YGR068W-A
96 nt
7.31
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YGR176W
YGR176W
348 nt
7.31
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
AIR1
YIL079C
1083 nt
7.31
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
PGU1
YJR153W
1086 nt
7.31
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YLR118C
YLR118C
684 nt
7.31
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YGP1
YNL160W
1065 nt
7.31
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YOL024W
YOL024W
519 nt
7.31
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YPL062W
YPL062W
405 nt
7.31
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
CDC13
YDL220C
2775 nt
7.31
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
GUS1
YGL245W
2127 nt
7.3
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
TIM54
YJL054W
1437 nt
7.3
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
RMD5
YDR255C
1266 nt
7.3
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
MCM21
YDR318W
1107 nt
7.3
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
PCL6
YER059W
1263 nt
7.3
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
tR(ACG)J
tR(ACG)J
73 nt
7.3
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
APS3
YJL024C
585 nt
7.3
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
ARO9
YHR137W
1542 nt
7.3
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YJR015W
YJR015W
1533 nt
7.3
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YDL241W
YDL241W
372 nt
7.29
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YGR182C
YGR182C
354 nt
7.29
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
RRT7
YLL030C
342 nt
7.29
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YLR169W
YLR169W
354 nt
7.29
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YNL019C
YNL019C
855 nt
7.29
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YNL033W
YNL033W
855 nt
7.29
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YNL228W
YNL228W
777 nt
7.29
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
UBS1
YBR165W
834 nt
7.29
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
MST1
YKL194C
1389 nt
7.29
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
CHS5
YLR330W
2016 nt
7.28
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
NUD1
YOR373W
2556 nt
7.28
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
TRP4
YDR354W
1143 nt
7.28
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
HSP12
YFL014W
330 nt
7.28
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YAL056C-A
YAL056C-A
351 nt
7.28
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
YLR198C
YLR198C
360 nt
7.28
□□□□□ -1.24
XKS1
P42826
RCK1
YGL158W
1539 nt
7.27
□□□□□ -1.25
XKS1
P42826
BDF2
YDL070W
1917 nt
7.27
□□□□□ -1.25
XKS1
P42826
LSM6
YDR378C
261 nt
7.27
□□□□□ -1.25
XKS1
P42826
BIM1
YER016W
1035 nt
7.27
□□□□□ -1.25
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