Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 SCT1YBL011W 2280 nt5.87□□□□□ -1.47
SEC28P40509 PKC1YBL105C 3456 nt5.86□□□□□ -1.47
SEC28P40509 RMD9YGL107C 1941 nt5.86□□□□□ -1.47
SEC28P40509 VBA1YMR088C 1689 nt5.86□□□□□ -1.47
SEC28P40509 GIT1YCR098C 1557 nt5.86□□□□□ -1.47
SEC28P40509 SKI2YLR398C 3864 nt5.86□□□□□ -1.47
SEC28P40509 AI5_BETAQ0075 1065 nt5.86□□□□□ -1.47
SEC28P40509 RPS2YGL123W 765 nt5.86□□□□□ -1.47
SEC28P40509 RHO4YKR055W 876 nt5.86□□□□□ -1.47
SEC28P40509 MRPS5YBR251W 924 nt5.86□□□□□ -1.47
SEC28P40509 PRI2YKL045W 1587 nt5.85□□□□□ -1.47
SEC28P40509 DIA3YDL024C 1407 nt5.85□□□□□ -1.47
SEC28P40509 MOG1YJR074W 657 nt5.85□□□□□ -1.47
SEC28P40509 HAL1YPR005C 885 nt5.85□□□□□ -1.47
SEC28P40509 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.85□□□□□ -1.47
SEC28P40509 RGD1YBR260C 2001 nt5.85□□□□□ -1.47
SEC28P40509 PPR1YLR014C 2715 nt5.85□□□□□ -1.47
SEC28P40509 YLH47YPR125W 1365 nt5.84□□□□□ -1.47
SEC28P40509 ADE12YNL220W 1302 nt5.84□□□□□ -1.47
SEC28P40509 NPA3YJR072C 1158 nt5.84□□□□□ -1.47
SEC28P40509 TAL1YLR354C 1008 nt5.84□□□□□ -1.47
SEC28P40509 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.84□□□□□ -1.47
SEC28P40509 ERC1YHR032W 1746 nt5.83□□□□□ -1.48
SEC28P40509 NUP1YOR098C 3231 nt5.83□□□□□ -1.48
SEC28P40509 RPL7AYGL076C 735 nt5.83□□□□□ -1.48
SEC28P40509 YHR140WYHR140W 720 nt5.83□□□□□ -1.48
SEC28P40509 RPL7BYPL198W 735 nt5.83□□□□□ -1.48
SEC28P40509 SRG1SRG1 551 nt5.82□□□□□ -1.48
SEC28P40509 PEX7YDR142C 1128 nt5.82□□□□□ -1.48
SEC28P40509 RME1YGR044C 903 nt5.82□□□□□ -1.48
SEC28P40509 LYS12YIL094C 1116 nt5.82□□□□□ -1.48
SEC28P40509 ENV7YPL236C 1095 nt5.82□□□□□ -1.48
SEC28P40509 CLB2YPR119W 1476 nt5.82□□□□□ -1.48
SEC28P40509 SPC97YHR172W 2472 nt5.82□□□□□ -1.48
SEC28P40509 VNX1YNL321W 2727 nt5.82□□□□□ -1.48
SEC28P40509 YDR387CYDR387C 1668 nt5.82□□□□□ -1.48
SEC28P40509 PRE3YJL001W 648 nt5.81□□□□□ -1.48
SEC28P40509 UBC11YOR339C 471 nt5.81□□□□□ -1.48
SEC28P40509 URA7YBL039C 1740 nt5.81□□□□□ -1.48
SEC28P40509 APE3YBR286W 1614 nt5.81□□□□□ -1.48
SEC28P40509 VRP1YLR337C 2454 nt5.81□□□□□ -1.48
SEC28P40509 RCK1YGL158W 1539 nt5.8□□□□□ -1.48
SEC28P40509 KSS1YGR040W 1107 nt5.8□□□□□ -1.48
SEC28P40509 ERP5YHR110W 639 nt5.8□□□□□ -1.48
SEC28P40509 NPT1YOR209C 1290 nt5.8□□□□□ -1.48
SEC28P40509 ODC2YOR222W 924 nt5.8□□□□□ -1.48
SEC28P40509 YME1YPR024W 2244 nt5.8□□□□□ -1.48
SEC28P40509 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.79□□□□□ -1.48
SEC28P40509 CDC10YCR002C 969 nt5.79□□□□□ -1.48
SEC28P40509 VAM7YGL212W 951 nt5.79□□□□□ -1.48
SEC28P40509 ZRT2YLR130C 1269 nt5.79□□□□□ -1.48
SEC28P40509 YDR109CYDR109C 2148 nt5.78□□□□□ -1.48
SEC28P40509 IDP1YDL066W 1287 nt5.78□□□□□ -1.48
SEC28P40509 TRP1YDR007W 675 nt5.78□□□□□ -1.48
SEC28P40509 YER010CYER010C 705 nt5.78□□□□□ -1.48
SEC28P40509 YGR176WYGR176W 348 nt5.78□□□□□ -1.48
SEC28P40509 MID1YNL291C 1647 nt5.77□□□□□ -1.48
SEC28P40509 PTR2YKR093W 1806 nt5.77□□□□□ -1.49
SEC28P40509 ECM3YOR092W 1842 nt5.77□□□□□ -1.49
SEC28P40509 STM1YLR150W 822 nt5.77□□□□□ -1.49
SEC28P40509 YOL131WYOL131W 327 nt5.77□□□□□ -1.49
SEC28P40509 SUE1YPR151C 621 nt5.77□□□□□ -1.49
SEC28P40509 ATP1YBL099W 1638 nt5.77□□□□□ -1.49
SEC28P40509 VPS1YKR001C 2115 nt5.77□□□□□ -1.49
SEC28P40509 YEH1YLL012W 1722 nt5.77□□□□□ -1.49
SEC28P40509 CTS2YDR371W 1536 nt5.76□□□□□ -1.49
SEC28P40509 YDL057WYDL057W 987 nt5.76□□□□□ -1.49
SEC28P40509 CHO1YER026C 831 nt5.76□□□□□ -1.49
SEC28P40509 SCO2YBR024W 906 nt5.76□□□□□ -1.49
SEC28P40509 YBR144CYBR144C 315 nt5.76□□□□□ -1.49
SEC28P40509 AMD1YML035C 2433 nt5.76□□□□□ -1.49
SEC28P40509 HAS1YMR290C 1518 nt5.75□□□□□ -1.49
SEC28P40509 GLE1YDL207W 1617 nt5.75□□□□□ -1.49
SEC28P40509 IPK1YDR315C 846 nt5.75□□□□□ -1.49
SEC28P40509 RHO3YIL118W 696 nt5.75□□□□□ -1.49
SEC28P40509 KRE9YJL174W 831 nt5.75□□□□□ -1.49
SEC28P40509 AAD15YOL165C 432 nt5.75□□□□□ -1.49
SEC28P40509 COR1YBL045C 1374 nt5.75□□□□□ -1.49
SEC28P40509 YFL042CYFL042C 2025 nt5.75□□□□□ -1.49
SEC28P40509 SIT4YDL047W 936 nt5.74□□□□□ -1.49
SEC28P40509 SNZ3YFL059W 897 nt5.74□□□□□ -1.49
SEC28P40509 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.74□□□□□ -1.49
SEC28P40509 YKL107WYKL107W 930 nt5.74□□□□□ -1.49
SEC28P40509 YNL228WYNL228W 777 nt5.74□□□□□ -1.49
SEC28P40509 SNZ2YNL333W 897 nt5.74□□□□□ -1.49
SEC28P40509 CPA1YOR303W 1236 nt5.74□□□□□ -1.49
SEC28P40509 FHL1YPR104C 2811 nt5.74□□□□□ -1.49
SEC28P40509 UBX2YML013W 1755 nt5.73□□□□□ -1.49
SEC28P40509 GUA1YMR217W 1578 nt5.73□□□□□ -1.49
SEC28P40509 PFA3YNL326C 1011 nt5.73□□□□□ -1.49
SEC28P40509 ESC8YOL017W 2145 nt5.73□□□□□ -1.49
SEC28P40509 CLB1YGR108W 1416 nt5.73□□□□□ -1.49
SEC28P40509 SMF2YHR050W 1650 nt5.72□□□□□ -1.49
SEC28P40509 MNS1YJR131W 1650 nt5.72□□□□□ -1.49
SEC28P40509 KEX2YNL238W 2445 nt5.72□□□□□ -1.49
SEC28P40509 YDL114WYDL114W 927 nt5.72□□□□□ -1.49
SEC28P40509 UGX2YDL169C 672 nt5.72□□□□□ -1.49
SEC28P40509 PDE1YGL248W 1110 nt5.72□□□□□ -1.49
SEC28P40509 APS3YJL024C 585 nt5.72□□□□□ -1.49
SEC28P40509 ECM19YLR390W 339 nt5.72□□□□□ -1.49
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