Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 RCL1YOL010W 1104 nt8.56□□□□□ -1.04
TY2B-BQ12491 DPH2YKL191W 1605 nt8.56□□□□□ -1.04
TY2B-BQ12491 RPS2YGL123W 765 nt8.56□□□□□ -1.04
TY2B-BQ12491 PPR1YLR014C 2715 nt8.55□□□□□ -1.04
TY2B-BQ12491 RRN10YBL025W 438 nt8.55□□□□□ -1.04
TY2B-BQ12491 MET8YBR213W 825 nt8.55□□□□□ -1.04
TY2B-BQ12491 MNN5YJL186W 1761 nt8.54□□□□□ -1.04
TY2B-BQ12491 GAT1YFL021W 1533 nt8.54□□□□□ -1.04
TY2B-BQ12491 GCS1YDL226C 1059 nt8.53□□□□□ -1.04
TY2B-BQ12491 FHN1YGR131W 525 nt8.53□□□□□ -1.04
TY2B-BQ12491 DTR1YBR180W 1719 nt8.53□□□□□ -1.04
TY2B-BQ12491 YOL163WYOL163W 510 nt8.52□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 TEF1YPR080W 1377 nt8.52□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 TEF2YBR118W 1377 nt8.52□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 RQC1YDR333C 2172 nt8.52□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 YPK2YMR104C 2034 nt8.52□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 RPT1YKL145W 1404 nt8.52□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 FAA4YMR246W 2085 nt8.51□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 VNX1YNL321W 2727 nt8.51□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 GCD11YER025W 1584 nt8.51□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 YNR048WYNR048W 1182 nt8.51□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 ERC1YHR032W 1746 nt8.51□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 JAC1YGL018C 555 nt8.5□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 HAP2YGL237C 798 nt8.5□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 MGR2YPL098C 342 nt8.5□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 IFA38YBR159W 1044 nt8.5□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 SUA5YGL169W 1281 nt8.5□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 RAD3YER171W 2337 nt8.5□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 TRK2YKR050W 2670 nt8.49□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 ARO2YGL148W 1131 nt8.49□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 BGL2YGR282C 942 nt8.49□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 STM1YLR150W 822 nt8.49□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 YHR045WYHR045W 1683 nt8.49□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 SUP2tY(GUA)D 75 nt8.48□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 SUP11tY(GUA)F1 75 nt8.48□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 SUP6tY(GUA)F2 75 nt8.48□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 SUP7tY(GUA)J1 75 nt8.48□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 SUP4tY(GUA)J2 75 nt8.48□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 SUP5tY(GUA)M1 75 nt8.48□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 SUP8tY(GUA)M2 75 nt8.48□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 SUP3tY(GUA)O 75 nt8.48□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 PRE7YBL041W 726 nt8.48□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 ICE2YIL090W 1476 nt8.47□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 YJL068CYJL068C 900 nt8.47□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 PPS1YBR276C 2424 nt8.47□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 TDA6YPR157W 1404 nt8.46□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 OST3YOR085W 1053 nt8.46□□□□□ -1.05
TY2B-BQ12491 VPS1YKR001C 2115 nt8.46□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 ILV2YMR108W 2064 nt8.46□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 UGO1YDR470C 1509 nt8.46□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 PGK1YCR012W 1251 nt8.45□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 RPB4YJL140W 666 nt8.45□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 ALT1YLR089C 1779 nt8.44□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 RME1YGR044C 903 nt8.44□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 BUL1YMR275C 2931 nt8.43□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 CIR2YOR356W 1896 nt8.43□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 FEX1YOR390W 1128 nt8.43□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 RBD2YPL246C 789 nt8.43□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 FEX2YPL279C 1128 nt8.43□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 HSP78YDR258C 2436 nt8.42□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 ARP3YJR065C 1350 nt8.41□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 COX18YGR062C 951 nt8.41□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 CTF8YHR191C 402 nt8.41□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 CAM1YPL048W 1248 nt8.41□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 YER148W-AYER148W-A 579 nt8.4□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 ATO2YNR002C 849 nt8.4□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 NUP116YMR047C 3342 nt8.4□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 NOP8YOL144W 1455 nt8.4□□□□□ -1.06
TY2B-BQ12491 EMP46YLR080W 1335 nt8.4□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 PAD1YDR538W 729 nt8.4□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 POM33YLL023C 840 nt8.4□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 IES1YFL013C 2079 nt8.39□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 KSS1YGR040W 1107 nt8.39□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 YJL171CYJL171C 1191 nt8.39□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 YIL177CYIL177C 5277 nt8.39□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 DED81YHR019C 1665 nt8.39□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 PRP45YAL032C 1140 nt8.38□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 ROX3YBL093C 663 nt8.38□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 TOS4YLR183C 1470 nt8.38□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 GPI11YDR302W 660 nt8.38□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 MLF3YNL074C 1359 nt8.37□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 FET3YMR058W 1911 nt8.37□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 YDR134CYDR134C 411 nt8.37□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 YJR012CYJR012C 624 nt8.37□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 ARA2YMR041C 1008 nt8.36□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 YPR195CYPR195C 330 nt8.35□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 TAX4YJL083W 1815 nt8.35□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 COQ6YGR255C 1440 nt8.34□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 MSH1YHR120W 2880 nt8.34□□□□□ -1.07
TY2B-BQ12491 PHO3YBR092C 1404 nt8.34□□□□□ -1.08
TY2B-BQ12491 DFG5YMR238W 1377 nt8.33□□□□□ -1.08
TY2B-BQ12491 YER186CYER186C 921 nt8.33□□□□□ -1.08
TY2B-BQ12491 SMF2YHR050W 1650 nt8.33□□□□□ -1.08
TY2B-BQ12491 RPL3YOR063W 1164 nt8.33□□□□□ -1.08
TY2B-BQ12491 YEH1YLL012W 1722 nt8.32□□□□□ -1.08
TY2B-BQ12491 TUB2YFL037W 1374 nt8.32□□□□□ -1.08
TY2B-BQ12491 YML133CYML133C 4125 nt8.32□□□□□ -1.08
TY2B-BQ12491 SKN1YGR143W 2316 nt8.32□□□□□ -1.08
TY2B-BQ12491 CAB4YGR277C 918 nt8.31□□□□□ -1.08
TY2B-BQ12491 TOM5YPR133W-A 153 nt8.31□□□□□ -1.08
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