Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	HAP2	YGL237C	798 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	APN1	YKL114C	1104 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	IDP3	YNL009W	1263 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	RHO2	YNL090W	579 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	MRPS16	YPL013C	366 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	YPR114W	YPR114W	948 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	SUE1	YPR151C	621 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	ECM3	YOR092W	1842 nt		5.69	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	UTP9	YHR196W	1728 nt		5.68	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	RVB2	YPL235W	1416 nt		5.68	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	CDC34	YDR054C	888 nt		5.68	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	YER186C	YER186C	921 nt		5.68	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	CUP2	YGL166W	678 nt		5.68	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	MRPL10	YNL284C	969 nt		5.68	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	SIA1	YOR137C	1869 nt		5.68	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	ERC1	YHR032W	1746 nt		5.68	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	MCM3	YEL032W	2916 nt		5.68	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	UBX2	YML013W	1755 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	BUD9	YGR041W	1644 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	SNZ3	YFL059W	897 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	NCS6	YGL211W	1080 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	SNZ2	YNL333W	897 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	COS10	YNR075W	1125 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	RRT2	YBR246W	1164 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	TFC6	YDR362C	2019 nt		5.67	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	RGT1	YKL038W	3513 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	ABZ1	YNR033W	2364 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	PDC1	YLR044C	1692 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	PKC1	YBL105C	3456 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	YPK2	YMR104C	2034 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	UGX2	YDL169C	672 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	YGR176W	YGR176W	348 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	YIR020W-A	YIR020W-A	243 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	PRS1	YKL181W	1284 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	SEC17	YBL050W	879 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	HOR7	YMR251W-A	180 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	RBA50	YDR527W	1320 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	HPF1	YOL155C	2904 nt		5.66	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	NOP2	YNL061W	1857 nt		5.65	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	IMG1	YCR046C	510 nt		5.65	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	YET3	YDL072C	612 nt		5.65	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	RPS2	YGL123W	765 nt		5.65	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	VAM7	YGL212W	951 nt		5.65	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	RME1	YGR044C	903 nt		5.65	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	PDB1	YBR221C	1101 nt		5.65	□□□□□ -1.5
VIK1	Q12045	MID1	YNL291C	1647 nt		5.65	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	MDM31	YHR194W	1740 nt		5.65	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	ATG4	YNL223W	1485 nt		5.64	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	HEM3	YDL205C	984 nt		5.64	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	YDR034W-B	YDR034W-B	156 nt		5.64	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	SFC1	YJR095W	969 nt		5.64	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	VPS1	YKR001C	2115 nt		5.64	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	FOB1	YDR110W	1701 nt		5.64	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	YFR052C-A	YFR052C-A	306 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	MED6	YHR058C	888 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	MPC2	YHR162W	390 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	ASK1	YKL052C	879 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	HAP3	YBL021C	435 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	PSH1	YOL054W	1221 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	TSR3	YOR006C	942 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	ODC2	YOR222W	924 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	TAE1	YBR261C	699 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	YEL077C	YEL077C	3834 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	OPT1	YJL212C	2400 nt		5.63	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	UBA1	YKL210W	3075 nt		5.62	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	ACC1	YNR016C	6702 nt		5.62	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	MAK31	YCR020C-A	267 nt		5.62	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	YDR187C	YDR187C	519 nt		5.62	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	RHO3	YIL118W	696 nt		5.62	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	VPS24	YKL041W	675 nt		5.62	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	YML012C-A	YML012C-A	378 nt		5.62	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	PPR1	YLR014C	2715 nt		5.62	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	HOS1	YPR068C	1413 nt		5.62	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	YPR196W	YPR196W	1413 nt		5.62	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	SIP5	YMR140W	1470 nt		5.62	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	SIT1	YEL065W	1887 nt		5.62	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	QDR3	YBR043C	2070 nt		5.62	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	DIA3	YDL024C	1407 nt		5.61	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	YMR027W	YMR027W	1413 nt		5.61	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	YMR155W	YMR155W	1644 nt		5.61	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	YRF1-4	YLR466W	4149 nt		5.61	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	YKL031W	YKL031W	414 nt		5.6	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	YLR361C-A	YLR361C-A	297 nt		5.6	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	GYP1	YOR070C	1914 nt		5.6	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	NRD1	YNL251C	1728 nt		5.6	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	ICL1	YER065C	1674 nt		5.59	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	RPT2	YDL007W	1314 nt		5.59	□□□□□ -1.51
VIK1	Q12045	DUR1,2	YBR208C	5508 nt		5.59	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	RRN3	YKL125W	1884 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	YIL060W	YIL060W	435 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	SRY1	YKL218C	981 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	CAF40	YNL288W	1122 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	YPR098C	YPR098C	486 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	RAD24	YER173W	1980 nt		5.58	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	KSS1	YGR040W	1107 nt		5.57	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	SUP19	tS(UGA)E	82 nt		5.57	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	SUP17	tS(UGA)I	82 nt		5.57	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	SUP16	tS(UGA)P	82 nt		5.57	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	STM1	YLR150W	822 nt		5.57	□□□□□ -1.52
VIK1	Q12045	GIT1	YCR098C	1557 nt		5.57	□□□□□ -1.52

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