Protein–RNA interactions for Protein: Q07657

SHS1, Seventh homolog of septin 1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHS1Q07657 YBR124WYBR124W 360 nt6.05□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 PYC1YGL062W 3537 nt6.05□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 NSE5YML023C 1671 nt6.04□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 HIS7YBR248C 1659 nt6.04□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 BUD9YGR041W 1644 nt6.04□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 YER010CYER010C 705 nt6.04□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 YER148W-AYER148W-A 579 nt6.04□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 YER186CYER186C 921 nt6.04□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 SYN8YAL014C 768 nt6.04□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 ELA1YNL230C 1140 nt6.04□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 GAT1YFL021W 1533 nt6.04□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 AIM3YBR108W 2844 nt6.03□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 KDX1YKL161C 1302 nt6.03□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 HSP78YDR258C 2436 nt6.03□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 ARG1YOL058W 1263 nt6.03□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 YTH1YPR107C 627 nt6.03□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 YFR006WYFR006W 1608 nt6.03□□□□□ -1.44
SHS1Q07657 KNS1YLL019C 2214 nt6.02□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 YFL052WYFL052W 1398 nt6.02□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 SNU71YGR013W 1863 nt6.01□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 YME1YPR024W 2244 nt6.01□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 CIS3YJL158C 684 nt6.01□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 YLR194CYLR194C 765 nt6.01□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 VMA4YOR332W 702 nt6.01□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 ATF1YOR377W 1578 nt6.01□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 IMA5YJL216C 1746 nt6□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 RMA1YKL132C 1293 nt6□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 ECM30YLR436C 3825 nt6□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 VNX1YNL321W 2727 nt5.99□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 CMR1YDL156W 1569 nt5.99□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 HMS2YJR147W 1077 nt5.99□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 COX9YDL067C 180 nt5.98□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 YGR176WYGR176W 348 nt5.98□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 DAL82YNL314W 768 nt5.98□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 VPS4YPR173C 1314 nt5.98□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 YAP1801YHR161C 1914 nt5.97□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 BUL1YMR275C 2931 nt5.97□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 GIR2YDR152W 798 nt5.97□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 DAL3YIR032C 588 nt5.97□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.97□□□□□ -1.45
SHS1Q07657 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.96□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.96□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.96□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.96□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.96□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.96□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.96□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.96□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.96□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.96□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.96□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 YML6YML025C 861 nt5.96□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 PIN2YOR104W 849 nt5.96□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 RTT106YNL206C 1368 nt5.95□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 ARP2YDL029W 1176 nt5.95□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.95□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 TPK1YJL164C 1194 nt5.95□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 PGU1YJR153W 1086 nt5.95□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 TFS1YLR178C 660 nt5.95□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 HCR1YLR192C 798 nt5.95□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 CHS5YLR330W 2016 nt5.95□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 HIR1YBL008W 2523 nt5.95□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 SMF2YHR050W 1650 nt5.94□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 COX26YDR119W-A 201 nt5.94□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 SNZ3YFL059W 897 nt5.94□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 MLC1YGL106W 450 nt5.94□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 SNZ2YNL333W 897 nt5.94□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 YDR514CYDR514C 1452 nt5.94□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 YEH1YLL012W 1722 nt5.94□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 YDL057WYDL057W 987 nt5.93□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 STL1YDR536W 1710 nt5.92□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 SHE10YGL228W 1734 nt5.92□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 YDL034WYDL034W 345 nt5.92□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 CAD1YDR423C 1230 nt5.92□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 YJR115WYJR115W 510 nt5.92□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 PUS5YLR165C 765 nt5.92□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 PGA3YML125C 939 nt5.92□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 TRK2YKR050W 2670 nt5.91□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 RPL7AYGL076C 735 nt5.91□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 COS9YKL219W 1224 nt5.91□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.91□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 CAR1YPL111W 1002 nt5.91□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 RPL7BYPL198W 735 nt5.91□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 TEA1YOR337W 2280 nt5.91□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 QDR3YBR043C 2070 nt5.9□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 GAA1YLR088W 1845 nt5.9□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 UGO1YDR470C 1509 nt5.9□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 MID1YNL291C 1647 nt5.9□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 KNH1YDL049C 807 nt5.9□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 PPM1YDR435C 987 nt5.9□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 YFL064CYFL064C 525 nt5.9□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 GFD1YMR255W 567 nt5.9□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 YBL070CYBL070C 321 nt5.9□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 YPR202WYPR202W 717 nt5.9□□□□□ -1.46
SHS1Q07657 AVT4YNL101W 2142 nt5.9□□□□□ -1.47
SHS1Q07657 MRPL13YKR006C 795 nt5.89□□□□□ -1.47
SHS1Q07657 VPS5YOR069W 2028 nt5.89□□□□□ -1.47
SHS1Q07657 ATP1YBL099W 1638 nt5.88□□□□□ -1.47
SHS1Q07657 YLR118CYLR118C 684 nt5.88□□□□□ -1.47
SHS1Q07657 RBD2YPL246C 789 nt5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 113.2 ms