Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	DFG5	YMR238W	1377 nt		4.64	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	ISN1	YOR155C	1353 nt		4.64	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	TRP3	YKL211C	1455 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	MNN5	YJL186W	1761 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	UBX2	YML013W	1755 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	DBP8	YHR169W	1296 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	CTR2	YHR175W	570 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	YOR111W	YOR111W	699 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	SCO2	YBR024W	906 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	DAP1	YPL170W	459 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	YLL067C	YLL067C	3618 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	OCA5	YHL029C	2040 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	CRF1	YDR223W	1404 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	RVB2	YPL235W	1416 nt		4.63	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	PIF1	YML061C	2580 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	SIP5	YMR140W	1470 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	CNE1	YAL058W	1509 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	ARP1	YHR129C	1155 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	YJR085C	YJR085C	318 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	YKL153W	YKL153W	510 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	GUD1	YDL238C	1470 nt		4.62	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	PMT2	YAL023C	2280 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	VTC2	YFL004W	2487 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	SIT1	YEL065W	1887 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	CDC16	YKL022C	2523 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	SNZ3	YFL059W	897 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	LDS1	YAL018C	978 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	RPO26	YPR187W	468 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	HST3	YOR025W	1344 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	OSW2	YLR054C	2175 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	WHI2	YOR043W	1461 nt		4.61	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	HIR1	YBL008W	2523 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	TFG2	YGR005C	1203 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	YHR218W-A	YHR218W-A	318 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	VPS24	YKL041W	675 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	TSA1	YML028W	591 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	YMR122C	YMR122C	375 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	YMR252C	YMR252C	405 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	SCS22	YBL091C-A	528 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	MDY2	YOL111C	639 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	YBL112C	YBL112C	318 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	BNA5	YLR231C	1362 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	YPR196W	YPR196W	1413 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	TBF1	YPL128C	1689 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	NSI1	YDR026C	1713 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	SEC39	YLR440C	2130 nt		4.6	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	ACC1	YNR016C	6702 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	PAB1	YER165W	1734 nt		4.59	□□□□□ -1.67
VAR1	P02381	KKQ8	YKL168C	2175 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	PSE1	YMR308C	3270 nt		4.58	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	CDC1	YDR182W	1476 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	YET3	YDL072C	612 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	TDH2	YJR009C	999 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	YHM2	YMR241W	945 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	YOL131W	YOL131W	327 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	MRPS16	YPL013C	366 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	ARN2	YHL047C	1863 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	DRS1	YLL008W	2259 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	SEC18	YBR080C	2277 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	MET7	YOR241W	1647 nt		4.57	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	TUL1	YKL034W	2277 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	MAK31	YCR020C-A	267 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	YEL068C	YEL068C	333 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	CHO1	YER026C	831 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	SUP2	tY(GUA)D	75 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	SUP11	tY(GUA)F1	75 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	SUP6	tY(GUA)F2	75 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	SUP7	tY(GUA)J1	75 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	SUP4	tY(GUA)J2	75 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	SUP5	tY(GUA)M1	75 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	SUP8	tY(GUA)M2	75 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	SUP3	tY(GUA)O	75 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	VMA4	YOR332W	702 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	DPH2	YKL191W	1605 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	VNX1	YNL321W	2727 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	FRS2	YFL022C	1512 nt		4.56	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	TUP1	YCR084C	2142 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	SIT4	YDL047W	936 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	VCX1	YDL128W	1236 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	CDC34	YDR054C	888 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	RPE1	YJL121C	717 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	YJR154W	YJR154W	1041 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	HAP3	YBL021C	435 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	ERI1	YPL096C-A	207 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	RPN7	YPR108W	1290 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	YPR114W	YPR114W	948 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	MDM31	YHR194W	1740 nt		4.55	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	MCM3	YEL032W	2916 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	OPI7	YDR360W	435 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	HVG1	YER039C	750 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	NCS6	YGL211W	1080 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	tR(ACG)D	tR(ACG)D	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	tR(ACG)E	tR(ACG)E	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	tR(ACG)K	tR(ACG)K	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	tR(ACG)L	tR(ACG)L	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	tR(ACG)O	tR(ACG)O	73 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	MDH1	YKL085W	1005 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	CAF40	YNL288W	1122 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	YNR040W	YNR040W	771 nt		4.54	□□□□□ -1.68
VAR1	P02381	WTM2	YOR229W	1404 nt		4.54	□□□□□ -1.68

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