Protein–RNA interactions for Protein: Q07887

LDB18, Protein LDB18, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB18Q07887 CNE1YAL058W 1509 nt5.89□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 KNS1YLL019C 2214 nt5.89□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.88□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 HAP2YGL237C 798 nt5.88□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 SHP1YBL058W 1272 nt5.88□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 YBR144CYBR144C 315 nt5.88□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 AVT4YNL101W 2142 nt5.87□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 YOL036WYOL036W 2286 nt5.87□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 ICT1YLR099C 1185 nt5.87□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 YNL200CYNL200C 741 nt5.87□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 YOR200WYOR200W 399 nt5.87□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 MRK1YDL079C 1506 nt5.87□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 LAG2YOL025W 1983 nt5.87□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 RAD3YER171W 2337 nt5.86□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 DJP1YIR004W 1299 nt5.86□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 YJU3YKL094W 942 nt5.86□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 YPL102CYPL102C 303 nt5.86□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 APE3YBR286W 1614 nt5.85□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 GIT1YCR098C 1557 nt5.85□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 snR82snR82 268 nt5.85□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 SNN1YNL086W 309 nt5.85□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 IMA5YJL216C 1746 nt5.85□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 HIS7YBR248C 1659 nt5.85□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 VRP1YLR337C 2454 nt5.84□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 COX9YDL067C 180 nt5.84□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 EGD2YHR193C 525 nt5.84□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 RPE1YJL121C 717 nt5.84□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 CIS3YJL158C 684 nt5.84□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 EFM3YJR129C 1020 nt5.84□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 CCP1YKR066C 1086 nt5.84□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 MPA43YNL249C 1629 nt5.84□□□□□ -1.47
LDB18Q07887 PUF3YLL013C 2640 nt5.83□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 YDR109CYDR109C 2148 nt5.83□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 ACS1YAL054C 2142 nt5.83□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 YPK2YMR104C 2034 nt5.83□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.83□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 LDB19YOR322C 2457 nt5.82□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 YER186CYER186C 921 nt5.82□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 LYS12YIL094C 1116 nt5.82□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 RPS9AYPL081W 594 nt5.82□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 CEF1YMR213W 1773 nt5.82□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 GLE1YDL207W 1617 nt5.81□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 YIL055CYIL055C 1884 nt5.81□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 RME1YGR044C 903 nt5.81□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 SNO4YMR322C 714 nt5.81□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 HSP33YOR391C 714 nt5.81□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 HSP32YPL280W 714 nt5.81□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 VPS4YPR173C 1314 nt5.8□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 RPS2YGL123W 765 nt5.8□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 NPA3YJR072C 1158 nt5.8□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 AMD1YML035C 2433 nt5.8□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 XBP1YIL101C 1944 nt5.8□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 GAT1YFL021W 1533 nt5.79□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.79□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 MDH3YDL078C 1032 nt5.79□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 DIA3YDL024C 1407 nt5.79□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 HXT17YNR072W 1695 nt5.79□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 HSP78YDR258C 2436 nt5.78□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 YDL114WYDL114W 927 nt5.78□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 PPM1YDR435C 987 nt5.78□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.78□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 RRP4YHR069C 1080 nt5.78□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 CBK1YNL161W 2271 nt5.78□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 VHT1YGR065C 1782 nt5.78□□□□□ -1.48
LDB18Q07887 YCL065WYCL065W 369 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 IRC7YFR055W 1023 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 KSS1YGR040W 1107 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 SYF2YGR129W 648 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 ERP5YHR110W 639 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 STM1YLR150W 822 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 TAL1YLR354C 1008 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 YML6YML025C 861 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 VMA4YOR332W 702 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 YEL020CYEL020C 1683 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 ERC1YHR032W 1746 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 ATG22YCL038C 1587 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 YDL172CYDL172C 480 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 CBP4YGR174C 513 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 YIL077CYIL077C 963 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 PAN6YIL145C 930 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 RPL10YLR075W 666 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 YBR124WYBR124W 360 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 YME1YPR024W 2244 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 MTF2YDL044C 1323 nt5.75□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 YRA1YDR381W 681 nt5.75□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 YEA6YEL006W 1008 nt5.75□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 YER010CYER010C 705 nt5.75□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 APS3YJL024C 585 nt5.75□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 SCO2YBR024W 906 nt5.75□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 YDR514CYDR514C 1452 nt5.75□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 YML082WYML082W 1950 nt5.75□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.74□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 YDL119CYDL119C 924 nt5.74□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 VNX1YNL321W 2727 nt5.73□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 MLC2YPR188C 492 nt5.73□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 PKC1YBL105C 3456 nt5.72□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 ATO3YDR384C 828 nt5.72□□□□□ -1.49
LDB18Q07887 YDL144CYDL144C 1071 nt5.71□□□□□ -1.5
LDB18Q07887 SEC20YDR498C 1152 nt5.71□□□□□ -1.5
LDB18Q07887 MRPL22YNL177C 930 nt5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.6 ms