Protein–RNA interactions for Protein: P47821

SSN8, RNA polymerase II holoenzyme cyclin-like subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSN8P47821 YLR312CYLR312C 1197 nt5.55□□□□□ -1.52
SSN8P47821 AVO2YMR068W 1281 nt5.55□□□□□ -1.52
SSN8P47821 TAF9YMR236W 474 nt5.55□□□□□ -1.52
SSN8P47821 CAM1YPL048W 1248 nt5.55□□□□□ -1.52
SSN8P47821 TFB4YPR056W 1017 nt5.55□□□□□ -1.52
SSN8P47821 RIM101YHL027W 1878 nt5.55□□□□□ -1.52
SSN8P47821 YLL067CYLL067C 3618 nt5.55□□□□□ -1.52
SSN8P47821 VTC2YFL004W 2487 nt5.54□□□□□ -1.52
SSN8P47821 PEX3YDR329C 1326 nt5.54□□□□□ -1.52
SSN8P47821 YLR123CYLR123C 330 nt5.54□□□□□ -1.52
SSN8P47821 NRM1YNR009W 750 nt5.54□□□□□ -1.52
SSN8P47821 NTH2YBR001C 2343 nt5.54□□□□□ -1.52
SSN8P47821 CCC2YDR270W 3015 nt5.54□□□□□ -1.52
SSN8P47821 EXO1YOR033C 2109 nt5.53□□□□□ -1.52
SSN8P47821 CCZ1YBR131W 2115 nt5.53□□□□□ -1.52
SSN8P47821 RPL7AYGL076C 735 nt5.53□□□□□ -1.52
SSN8P47821 VAM7YGL212W 951 nt5.53□□□□□ -1.52
SSN8P47821 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.53□□□□□ -1.52
SSN8P47821 MPM1YJL066C 759 nt5.53□□□□□ -1.52
SSN8P47821 MRPS18YNL306W 654 nt5.53□□□□□ -1.52
SSN8P47821 RPL7BYPL198W 735 nt5.53□□□□□ -1.52
SSN8P47821 RSC2YLR357W 2670 nt5.53□□□□□ -1.52
SSN8P47821 NOP2YNL061W 1857 nt5.53□□□□□ -1.52
SSN8P47821 YME1YPR024W 2244 nt5.52□□□□□ -1.53
SSN8P47821 VPS61YDR136C 573 nt5.52□□□□□ -1.53
SSN8P47821 VMA3YEL027W 483 nt5.52□□□□□ -1.53
SSN8P47821 MDE1YJR024C 735 nt5.52□□□□□ -1.53
SSN8P47821 AIM24YJR080C 1185 nt5.52□□□□□ -1.53
SSN8P47821 EFM3YJR129C 1020 nt5.52□□□□□ -1.53
SSN8P47821 SLD7YOR060C 774 nt5.52□□□□□ -1.53
SSN8P47821 ENV9YOR246C 993 nt5.52□□□□□ -1.53
SSN8P47821 CTF19YPL018W 1110 nt5.52□□□□□ -1.53
SSN8P47821 LDB16YCL005W 771 nt5.52□□□□□ -1.53
SSN8P47821 ELP2YGR200C 2367 nt5.51□□□□□ -1.53
SSN8P47821 TRP1YDR007W 675 nt5.51□□□□□ -1.53
SSN8P47821 POR1YNL055C 852 nt5.51□□□□□ -1.53
SSN8P47821 COQ3YOL096C 939 nt5.51□□□□□ -1.53
SSN8P47821 RKI1YOR095C 777 nt5.51□□□□□ -1.53
SSN8P47821 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.51□□□□□ -1.53
SSN8P47821 UBX2YML013W 1755 nt5.51□□□□□ -1.53
SSN8P47821 ISN1YOR155C 1353 nt5.51□□□□□ -1.53
SSN8P47821 SAL1YNL083W 1485 nt5.51□□□□□ -1.53
SSN8P47821 YMR027WYMR027W 1413 nt5.5□□□□□ -1.53
SSN8P47821 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.5□□□□□ -1.53
SSN8P47821 YNL019CYNL019C 855 nt5.5□□□□□ -1.53
SSN8P47821 YNL033WYNL033W 855 nt5.5□□□□□ -1.53
SSN8P47821 SCO2YBR024W 906 nt5.5□□□□□ -1.53
SSN8P47821 CCT8YJL008C 1707 nt5.5□□□□□ -1.53
SSN8P47821 CLB1YGR108W 1416 nt5.49□□□□□ -1.53
SSN8P47821 VAN1YML115C 1608 nt5.49□□□□□ -1.53
SSN8P47821 PGM1YKL127W 1713 nt5.49□□□□□ -1.53
SSN8P47821 ARE2YNR019W 1929 nt5.49□□□□□ -1.53
SSN8P47821 GCG1YER163C 699 nt5.49□□□□□ -1.53
SSN8P47821 OM45YIL136W 1182 nt5.49□□□□□ -1.53
SSN8P47821 SOG2YOR353C 2376 nt5.48□□□□□ -1.53
SSN8P47821 YNL108CYNL108C 813 nt5.48□□□□□ -1.53
SSN8P47821 PDR16YNL231C 1056 nt5.48□□□□□ -1.53
SSN8P47821 PMT2YAL023C 2280 nt5.48□□□□□ -1.53
SSN8P47821 YHL017WYHL017W 1599 nt5.47□□□□□ -1.53
SSN8P47821 YGR054WYGR054W 1929 nt5.47□□□□□ -1.53
SSN8P47821 COS6YGR295C 1146 nt5.47□□□□□ -1.53
SSN8P47821 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.47□□□□□ -1.53
SSN8P47821 MHT1YLL062C 975 nt5.47□□□□□ -1.53
SSN8P47821 MSO1YNR049C 633 nt5.47□□□□□ -1.53
SSN8P47821 ERI1YPL096C-A 207 nt5.47□□□□□ -1.53
SSN8P47821 ECM33YBR078W 1290 nt5.47□□□□□ -1.53
SSN8P47821 ECM31YBR176W 939 nt5.47□□□□□ -1.53
SSN8P47821 VPS4YPR173C 1314 nt5.47□□□□□ -1.53
SSN8P47821 OCA5YHL029C 2040 nt5.47□□□□□ -1.53
SSN8P47821 DRS1YLL008W 2259 nt5.46□□□□□ -1.53
SSN8P47821 ERG8YMR220W 1356 nt5.46□□□□□ -1.54
SSN8P47821 YDR278CYDR278C 318 nt5.46□□□□□ -1.54
SSN8P47821 MEH1YKR007W 555 nt5.46□□□□□ -1.54
SSN8P47821 YPR123CYPR123C 435 nt5.46□□□□□ -1.54
SSN8P47821 GPD2YOL059W 1323 nt5.46□□□□□ -1.54
SSN8P47821 DEF1YKL054C 2217 nt5.46□□□□□ -1.54
SSN8P47821 BNA5YLR231C 1362 nt5.45□□□□□ -1.54
SSN8P47821 YGL072CYGL072C 360 nt5.45□□□□□ -1.54
SSN8P47821 DBP8YHR169W 1296 nt5.45□□□□□ -1.54
SSN8P47821 CBT1YKL208W 816 nt5.45□□□□□ -1.54
SSN8P47821 SRL2YLR082C 1179 nt5.45□□□□□ -1.54
SSN8P47821 MDY2YOL111C 639 nt5.45□□□□□ -1.54
SSN8P47821 ILV6YCL009C 930 nt5.45□□□□□ -1.54
SSN8P47821 SRP101YDR292C 1866 nt5.45□□□□□ -1.54
SSN8P47821 IMA1YGR287C 1770 nt5.44□□□□□ -1.54
SSN8P47821 FOB1YDR110W 1701 nt5.44□□□□□ -1.54
SSN8P47821 MED6YHR058C 888 nt5.44□□□□□ -1.54
SSN8P47821 QCR8YJL166W 285 nt5.44□□□□□ -1.54
SSN8P47821 APN1YKL114C 1104 nt5.44□□□□□ -1.54
SSN8P47821 YKR045CYKR045C 552 nt5.44□□□□□ -1.54
SSN8P47821 TSR2YLR435W 618 nt5.44□□□□□ -1.54
SSN8P47821 BSC4YNL269W 396 nt5.44□□□□□ -1.54
SSN8P47821 RPO26YPR187W 468 nt5.44□□□□□ -1.54
SSN8P47821 ERG1YGR175C 1491 nt5.44□□□□□ -1.54
SSN8P47821 SSK22YCR073C 3996 nt5.44□□□□□ -1.54
SSN8P47821 DDC1YPL194W 1839 nt5.44□□□□□ -1.54
SSN8P47821 IMG1YCR046C 510 nt5.43□□□□□ -1.54
SSN8P47821 MRS1YIR021W 1092 nt5.43□□□□□ -1.54
SSN8P47821 LCB3YJL134W 1230 nt5.43□□□□□ -1.54
SSN8P47821 GTO3YMR251W 1101 nt5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 278.3 ms