Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRMT12Q53H54 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms