Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 EFM3YJR129C 1020 nt6.6□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 QRI5YLR204W 336 nt6.6□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 PRP24YMR268C 1335 nt6.59□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 YSC83YHR017W 1158 nt6.59□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 YLR123CYLR123C 330 nt6.59□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 APE4YHR113W 1473 nt6.59□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 FYV1YDR024W 486 nt6.58□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 DMA1YHR115C 1251 nt6.58□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 YLR312CYLR312C 1197 nt6.58□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 AVO2YMR068W 1281 nt6.58□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 ASR1YPR093C 867 nt6.58□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 BUD9YGR041W 1644 nt6.58□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 GPA2YER020W 1350 nt6.57□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 HEM2YGL040C 1029 nt6.57□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 RHO4YKR055W 876 nt6.57□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 YHL017WYHL017W 1599 nt6.57□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 EDE1YBL047C 4146 nt6.57□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 MKK2YPL140C 1521 nt6.56□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 MDH1YKL085W 1005 nt6.56□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 IMD1YAR073W 1212 nt6.56□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 YBL070CYBL070C 321 nt6.56□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 PLB2YMR006C 2121 nt6.56□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 FMP40YPL222W 2067 nt6.56□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 YFL052WYFL052W 1398 nt6.56□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 HSP104YLL026W 2727 nt6.55□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 ATG17YLR423C 1254 nt6.55□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 MSY1YPL097W 1479 nt6.54□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 RPL31BYLR406C 342 nt6.54□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 MRPS18YNL306W 654 nt6.54□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 YBR124WYBR124W 360 nt6.54□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 PPM2YOL141W 2088 nt6.54□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 XBP1YIL101C 1944 nt6.54□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 STT3YGL022W 2157 nt6.54□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 PGM1YKL127W 1713 nt6.53□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 CMR1YDL156W 1569 nt6.53□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 KEX2YNL238W 2445 nt6.53□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 LCP5YER127W 1074 nt6.53□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 ASF1YJL115W 840 nt6.53□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 DRE2YKR071C 1047 nt6.53□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 BSC4YNL269W 396 nt6.53□□□□□ -1.36
SEC39Q12745 YMR034CYMR034C 1305 nt6.52□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 YOL036WYOL036W 2286 nt6.52□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 CHS5YLR330W 2016 nt6.52□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 LCL3YGL085W 825 nt6.52□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 MIA40YKL195W 1212 nt6.52□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 MRPL19YNL185C 477 nt6.52□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 YPR123CYPR123C 435 nt6.52□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 VPS70YJR126C 2436 nt6.52□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 VPS4YPR173C 1314 nt6.51□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 BNS1YGR230W 414 nt6.51□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 YML083CYML083C 1257 nt6.51□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 TAF9YMR236W 474 nt6.51□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 YNR005CYNR005C 405 nt6.51□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 GPB2YAL056W 2643 nt6.51□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 LDB19YOR322C 2457 nt6.5□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 SCT1YBL011W 2280 nt6.5□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 SPG5YMR191W 1122 nt6.5□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 ILV6YCL009C 930 nt6.5□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 COA1YIL157C 594 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 DFR1YOR236W 636 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 NHP6BYBR089C-A 300 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 YIR007WYIR007W 2295 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 HXT15YDL245C 1704 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 HXT16YJR158W 1704 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 TNA1YGR260W 1605 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 GAA1YLR088W 1845 nt6.48□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 YHR020WYHR020W 2067 nt6.48□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 RPL7AYGL076C 735 nt6.48□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 TFG2YGR005C 1203 nt6.48□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 FMO1YHR176W 1299 nt6.48□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 RPL7BYPL198W 735 nt6.48□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 SFB3YHR098C 2790 nt6.48□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 STE13YOR219C 2796 nt6.47□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 CRH1YGR189C 1524 nt6.47□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 AI5_BETAQ0075 1065 nt6.47□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 REC107YJR021C 945 nt6.47□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 COQ3YOL096C 939 nt6.47□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 RKI1YOR095C 777 nt6.47□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 MRP51YPL118W 1035 nt6.47□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 SAL1YNL083W 1485 nt6.47□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 ELP3YPL086C 1674 nt6.46□□□□□ -1.37
SEC39Q12745 YNL120CYNL120C 486 nt6.46□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 HIS7YBR248C 1659 nt6.45□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 GCG1YER163C 699 nt6.45□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 MRS1YIR021W 1092 nt6.45□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 ATG36YJL185C 882 nt6.45□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 GEP5YLR091W 882 nt6.45□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.45□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 DBP9YLR276C 1785 nt6.44□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 YDR278CYDR278C 318 nt6.44□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 CDC11YJR076C 1248 nt6.44□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 MSN2YMR037C 2115 nt6.43□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 AIM24YJR080C 1185 nt6.43□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 YKL223WYKL223W 333 nt6.43□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 YLR296WYLR296W 327 nt6.43□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 NTG2YOL043C 1143 nt6.43□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 CLB1YGR108W 1416 nt6.42□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 CPA1YOR303W 1236 nt6.42□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 SSK22YCR073C 3996 nt6.42□□□□□ -1.38
SEC39Q12745 NUP49YGL172W 1419 nt6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 90.6 ms