Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 CTF19YPL018W 1110 nt6.43□□□□□ -1.38
SEC28P40509 ILV6YCL009C 930 nt6.43□□□□□ -1.38
SEC28P40509 MSS1YMR023C 1581 nt6.43□□□□□ -1.38
SEC28P40509 YMR027WYMR027W 1413 nt6.42□□□□□ -1.38
SEC28P40509 CCT8YJL008C 1707 nt6.42□□□□□ -1.38
SEC28P40509 HEM2YGL040C 1029 nt6.42□□□□□ -1.38
SEC28P40509 CLN1YMR199W 1641 nt6.42□□□□□ -1.38
SEC28P40509 RIX7YLL034C 2514 nt6.41□□□□□ -1.38
SEC28P40509 POP1YNL221C 2628 nt6.41□□□□□ -1.38
SEC28P40509 RKI1YOR095C 777 nt6.41□□□□□ -1.38
SEC28P40509 CYC8YBR112C 2901 nt6.41□□□□□ -1.38
SEC28P40509 DEF1YKL054C 2217 nt6.41□□□□□ -1.38
SEC28P40509 ALT2YDR111C 1524 nt6.4□□□□□ -1.38
SEC28P40509 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.4□□□□□ -1.38
SEC28P40509 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.4□□□□□ -1.38
SEC28P40509 MHT1YLL062C 975 nt6.4□□□□□ -1.38
SEC28P40509 LAG2YOL025W 1983 nt6.4□□□□□ -1.39
SEC28P40509 PXL1YKR090W 2121 nt6.4□□□□□ -1.39
SEC28P40509 RSP5YER125W 2430 nt6.39□□□□□ -1.39
SEC28P40509 DRS1YLL008W 2259 nt6.38□□□□□ -1.39
SEC28P40509 LDB19YOR322C 2457 nt6.38□□□□□ -1.39
SEC28P40509 NTE1YML059C 5040 nt6.38□□□□□ -1.39
SEC28P40509 COQ3YOL096C 939 nt6.38□□□□□ -1.39
SEC28P40509 ECM31YBR176W 939 nt6.38□□□□□ -1.39
SEC28P40509 PPT1YGR123C 1542 nt6.38□□□□□ -1.39
SEC28P40509 ARE2YNR019W 1929 nt6.38□□□□□ -1.39
SEC28P40509 YGR054WYGR054W 1929 nt6.37□□□□□ -1.39
SEC28P40509 PHO3YBR092C 1404 nt6.37□□□□□ -1.39
SEC28P40509 ERG8YMR220W 1356 nt6.37□□□□□ -1.39
SEC28P40509 YGR127WYGR127W 939 nt6.37□□□□□ -1.39
SEC28P40509 MEH1YKR007W 555 nt6.37□□□□□ -1.39
SEC28P40509 YOR111WYOR111W 699 nt6.37□□□□□ -1.39
SEC28P40509 UIP5YKR044W 1332 nt6.36□□□□□ -1.39
SEC28P40509 THI4YGR144W 981 nt6.36□□□□□ -1.39
SEC28P40509 MSO1YNR049C 633 nt6.36□□□□□ -1.39
SEC28P40509 RDL2YOR286W 450 nt6.36□□□□□ -1.39
SEC28P40509 ZWF1YNL241C 1518 nt6.35□□□□□ -1.39
SEC28P40509 GPD2YOL059W 1323 nt6.35□□□□□ -1.39
SEC28P40509 YKR045CYKR045C 552 nt6.35□□□□□ -1.39
SEC28P40509 YLR312CYLR312C 1197 nt6.35□□□□□ -1.39
SEC28P40509 YPR204WYPR204W 3099 nt6.34□□□□□ -1.39
SEC28P40509 PTC3YBL056W 1407 nt6.34□□□□□ -1.39
SEC28P40509 POP5YAL033W 522 nt6.34□□□□□ -1.39
SEC28P40509 RPO26YPR187W 468 nt6.34□□□□□ -1.39
SEC28P40509 CRP1YHR146W 1398 nt6.33□□□□□ -1.4
SEC28P40509 MED6YHR058C 888 nt6.33□□□□□ -1.4
SEC28P40509 QCR8YJL166W 285 nt6.33□□□□□ -1.4
SEC28P40509 SRL2YLR082C 1179 nt6.33□□□□□ -1.4
SEC28P40509 CHL4YDR254W 1377 nt6.32□□□□□ -1.4
SEC28P40509 IES1YFL013C 2079 nt6.32□□□□□ -1.4
SEC28P40509 FPR2YDR519W 408 nt6.32□□□□□ -1.4
SEC28P40509 NCS6YGL211W 1080 nt6.32□□□□□ -1.4
SEC28P40509 AIM20YIL158W 615 nt6.32□□□□□ -1.4
SEC28P40509 LCB3YJL134W 1230 nt6.32□□□□□ -1.4
SEC28P40509 TSR2YLR435W 618 nt6.32□□□□□ -1.4
SEC28P40509 GTO3YMR251W 1101 nt6.32□□□□□ -1.4
SEC28P40509 KTR1YOR099W 1182 nt6.32□□□□□ -1.4
SEC28P40509 YBR027CYBR027C 333 nt6.32□□□□□ -1.4
SEC28P40509 PTC4YBR125C 1182 nt6.32□□□□□ -1.4
SEC28P40509 SRP101YDR292C 1866 nt6.32□□□□□ -1.4
SEC28P40509 IVY1YDR229W 1362 nt6.31□□□□□ -1.4
SEC28P40509 EMW1YNL313C 2715 nt6.31□□□□□ -1.4
SEC28P40509 VPS61YDR136C 573 nt6.31□□□□□ -1.4
SEC28P40509 GTT3YEL017W 1014 nt6.31□□□□□ -1.4
SEC28P40509 DMA1YHR115C 1251 nt6.31□□□□□ -1.4
SEC28P40509 IES2YNL215W 963 nt6.31□□□□□ -1.4
SEC28P40509 HRQ1YDR291W 3234 nt6.31□□□□□ -1.4
SEC28P40509 YMR279CYMR279C 1623 nt6.31□□□□□ -1.4
SEC28P40509 ATG7YHR171W 1893 nt6.3□□□□□ -1.4
SEC28P40509 CCP1YKR066C 1086 nt6.3□□□□□ -1.4
SEC28P40509 BSC4YNL269W 396 nt6.3□□□□□ -1.4
SEC28P40509 EFT2YDR385W 2529 nt6.29□□□□□ -1.4
SEC28P40509 EFT1YOR133W 2529 nt6.29□□□□□ -1.4
SEC28P40509 YJR084WYJR084W 1272 nt6.29□□□□□ -1.4
SEC28P40509 ARG81YML099C 2643 nt6.29□□□□□ -1.4
SEC28P40509 BNA5YLR231C 1362 nt6.29□□□□□ -1.4
SEC28P40509 YML133CYML133C 4125 nt6.28□□□□□ -1.4
SEC28P40509 ICS3YJL077C 396 nt6.28□□□□□ -1.4
SEC28P40509 ATG17YLR423C 1254 nt6.28□□□□□ -1.4
SEC28P40509 SCS7YMR272C 1155 nt6.28□□□□□ -1.4
SEC28P40509 PCS60YBR222C 1632 nt6.28□□□□□ -1.4
SEC28P40509 TRP5YGL026C 2124 nt6.28□□□□□ -1.4
SEC28P40509 PGM1YKL127W 1713 nt6.28□□□□□ -1.4
SEC28P40509 EXG1YLR300W 1347 nt6.27□□□□□ -1.41
SEC28P40509 YEL020CYEL020C 1683 nt6.27□□□□□ -1.41
SEC28P40509 AAT2YLR027C 1257 nt6.27□□□□□ -1.41
SEC28P40509 FPR3YML074C 1236 nt6.27□□□□□ -1.41
SEC28P40509 REC114YMR133W 1287 nt6.27□□□□□ -1.41
SEC28P40509 NHA1YLR138W 2958 nt6.27□□□□□ -1.41
SEC28P40509 VPS72YDR485C 2388 nt6.26□□□□□ -1.41
SEC28P40509 YIL077CYIL077C 963 nt6.26□□□□□ -1.41
SEC28P40509 MOD5YOR274W 1287 nt6.26□□□□□ -1.41
SEC28P40509 IMA2YOL157C 1770 nt6.26□□□□□ -1.41
SEC28P40509 ASN1YPR145W 1719 nt6.25□□□□□ -1.41
SEC28P40509 YGL072CYGL072C 360 nt6.25□□□□□ -1.41
SEC28P40509 YKL153WYKL153W 510 nt6.25□□□□□ -1.41
SEC28P40509 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.25□□□□□ -1.41
SEC28P40509 RPS3YNL178W 723 nt6.25□□□□□ -1.41
SEC28P40509 SCS22YBL091C-A 528 nt6.25□□□□□ -1.41
SEC28P40509 YMC1YPR058W 924 nt6.25□□□□□ -1.41
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