Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD11P31277 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD11P31277 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms