Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 YSC83YHR017W 1158 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 ATG17YLR423C 1254 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 IMA5YJL216C 1746 nt6.33□□□□□ -1.4
HER1Q12276 IME2YJL106W 1938 nt6.33□□□□□ -1.4
HER1Q12276 HXT2YMR011W 1626 nt6.33□□□□□ -1.4
HER1Q12276 YNL165WYNL165W 1221 nt6.33□□□□□ -1.4
HER1Q12276 HXT15YDL245C 1704 nt6.33□□□□□ -1.4
HER1Q12276 HXT16YJR158W 1704 nt6.33□□□□□ -1.4
HER1Q12276 YIL055CYIL055C 1884 nt6.32□□□□□ -1.4
HER1Q12276 MPH3YJR160C 1809 nt6.32□□□□□ -1.4
HER1Q12276 YMR034CYMR034C 1305 nt6.32□□□□□ -1.4
HER1Q12276 PDA1YER178W 1263 nt6.32□□□□□ -1.4
HER1Q12276 RPL31BYLR406C 342 nt6.32□□□□□ -1.4
HER1Q12276 YPR130CYPR130C 408 nt6.32□□□□□ -1.4
HER1Q12276 snR30snR30 606 nt6.32□□□□□ -1.4
HER1Q12276 VBA5YKR105C 1749 nt6.32□□□□□ -1.4
HER1Q12276 GEF1YJR040W 2340 nt6.31□□□□□ -1.4
HER1Q12276 TPO3YPR156C 1869 nt6.31□□□□□ -1.4
HER1Q12276 SPG5YMR191W 1122 nt6.31□□□□□ -1.4
HER1Q12276 GET4YOR164C 939 nt6.31□□□□□ -1.4
HER1Q12276 IRS4YKR019C 1848 nt6.31□□□□□ -1.4
HER1Q12276 UTR2YEL040W 1404 nt6.31□□□□□ -1.4
HER1Q12276 PPM1YDR435C 987 nt6.3□□□□□ -1.4
HER1Q12276 REC107YJR021C 945 nt6.3□□□□□ -1.4
HER1Q12276 PLB2YMR006C 2121 nt6.3□□□□□ -1.4
HER1Q12276 RSC2YLR357W 2670 nt6.29□□□□□ -1.4
HER1Q12276 FBA1YKL060C 1080 nt6.29□□□□□ -1.4
HER1Q12276 SRN2YLR119W 642 nt6.29□□□□□ -1.4
HER1Q12276 YBR113WYBR113W 483 nt6.29□□□□□ -1.4
HER1Q12276 BIO3YNR058W 1443 nt6.28□□□□□ -1.4
HER1Q12276 PTC7YHR076W 1032 nt6.28□□□□□ -1.4
HER1Q12276 DUS4YLR405W 1104 nt6.28□□□□□ -1.4
HER1Q12276 YCL049CYCL049C 939 nt6.28□□□□□ -1.4
HER1Q12276 CRP1YHR146W 1398 nt6.28□□□□□ -1.4
HER1Q12276 HXT17YNR072W 1695 nt6.27□□□□□ -1.41
HER1Q12276 YLR184WYLR184W 348 nt6.27□□□□□ -1.41
HER1Q12276 NMT1YLR195C 1368 nt6.27□□□□□ -1.41
HER1Q12276 EDE1YBL047C 4146 nt6.27□□□□□ -1.41
HER1Q12276 CIA1YDR267C 993 nt6.26□□□□□ -1.41
HER1Q12276 GPI11YDR302W 660 nt6.26□□□□□ -1.41
HER1Q12276 YLR162WYLR162W 357 nt6.26□□□□□ -1.41
HER1Q12276 YML6YML025C 861 nt6.26□□□□□ -1.41
HER1Q12276 HMT1YBR034C 1047 nt6.26□□□□□ -1.41
HER1Q12276 TFB4YPR056W 1017 nt6.26□□□□□ -1.41
HER1Q12276 YHR020WYHR020W 2067 nt6.26□□□□□ -1.41
HER1Q12276 BRN1YBL097W 2265 nt6.25□□□□□ -1.41
HER1Q12276 YDL023CYDL023C 321 nt6.25□□□□□ -1.41
HER1Q12276 RPP1YHR062C 882 nt6.25□□□□□ -1.41
HER1Q12276 AVO2YMR068W 1281 nt6.25□□□□□ -1.41
HER1Q12276 HTZ1YOL012C 405 nt6.25□□□□□ -1.41
HER1Q12276 MOD5YOR274W 1287 nt6.25□□□□□ -1.41
HER1Q12276 MSS1YMR023C 1581 nt6.25□□□□□ -1.41
HER1Q12276 STT3YGL022W 2157 nt6.24□□□□□ -1.41
HER1Q12276 THI2YBR240C 1353 nt6.24□□□□□ -1.41
HER1Q12276 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt6.24□□□□□ -1.41
HER1Q12276 ATG36YJL185C 882 nt6.24□□□□□ -1.41
HER1Q12276 LDB7YBL006C 543 nt6.24□□□□□ -1.41
HER1Q12276 SML1YML058W 315 nt6.24□□□□□ -1.41
HER1Q12276 CCC2YDR270W 3015 nt6.24□□□□□ -1.41
HER1Q12276 PPM2YOL141W 2088 nt6.24□□□□□ -1.41
HER1Q12276 KEL1YHR158C 3495 nt6.23□□□□□ -1.41
HER1Q12276 YDR401WYDR401W 564 nt6.23□□□□□ -1.41
HER1Q12276 SQT1YIR012W 1296 nt6.23□□□□□ -1.41
HER1Q12276 TIF2YJL138C 1188 nt6.23□□□□□ -1.41
HER1Q12276 MIA40YKL195W 1212 nt6.23□□□□□ -1.41
HER1Q12276 TIF1YKR059W 1188 nt6.23□□□□□ -1.41
HER1Q12276 YNR005CYNR005C 405 nt6.23□□□□□ -1.41
HER1Q12276 NTG2YOL043C 1143 nt6.23□□□□□ -1.41
HER1Q12276 ERG10YPL028W 1197 nt6.23□□□□□ -1.41
HER1Q12276 CYS4YGR155W 1524 nt6.22□□□□□ -1.41
HER1Q12276 COX9YDL067C 180 nt6.22□□□□□ -1.41
HER1Q12276 DFR1YOR236W 636 nt6.22□□□□□ -1.41
HER1Q12276 APE4YHR113W 1473 nt6.22□□□□□ -1.41
HER1Q12276 VPS61YDR136C 573 nt6.21□□□□□ -1.42
HER1Q12276 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.21□□□□□ -1.42
HER1Q12276 ERP2YAL007C 648 nt6.21□□□□□ -1.42
HER1Q12276 RGD1YBR260C 2001 nt6.21□□□□□ -1.42
HER1Q12276 YML133CYML133C 4125 nt6.2□□□□□ -1.42
HER1Q12276 YMR027WYMR027W 1413 nt6.2□□□□□ -1.42
HER1Q12276 MRPS28YDR337W 861 nt6.2□□□□□ -1.42
HER1Q12276 BMT5YIL096C 1011 nt6.2□□□□□ -1.42
HER1Q12276 YLR123CYLR123C 330 nt6.2□□□□□ -1.42
HER1Q12276 OST3YOR085W 1053 nt6.2□□□□□ -1.42
HER1Q12276 MSY1YPL097W 1479 nt6.2□□□□□ -1.42
HER1Q12276 RIX7YLL034C 2514 nt6.2□□□□□ -1.42
HER1Q12276 OPI7YDR360W 435 nt6.19□□□□□ -1.42
HER1Q12276 HEM2YGL040C 1029 nt6.19□□□□□ -1.42
HER1Q12276 AIM20YIL158W 615 nt6.19□□□□□ -1.42
HER1Q12276 YJL163CYJL163C 1668 nt6.19□□□□□ -1.42
HER1Q12276 HIS7YBR248C 1659 nt6.19□□□□□ -1.42
HER1Q12276 OAC1YKL120W 975 nt6.18□□□□□ -1.42
HER1Q12276 ACS1YAL054C 2142 nt6.18□□□□□ -1.42
HER1Q12276 YLR312CYLR312C 1197 nt6.18□□□□□ -1.42
HER1Q12276 SWP1YMR149W 861 nt6.18□□□□□ -1.42
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