Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 OGG1YML060W 1131 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 ARA2YMR041C 1008 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 DAL7YIR031C 1665 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 PTC3YBL056W 1407 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 SRL2YLR082C 1179 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 PTC4YBR125C 1182 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 YMR279CYMR279C 1623 nt6.6□□□□□ -1.35 RIP-Chip
PUF2Q12221 PPH22YDL188C 1134 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 DYS1YHR068W 1164 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 COX16YJL003W 357 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 MIA40YKL195W 1212 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 YMR295CYMR295C 594 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 OPI11YPR044C 354 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 HEM1YDR232W 1647 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 SEC23YPR181C 2307 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 FHN1YGR131W 525 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 YNL120CYNL120C 486 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 TOS6YNL300W 309 nt6.58□□□□□ -1.36 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 EFM1YHL039W 1758 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 YPR196WYPR196W 1413 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 HAL5YJL165C 2568 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 GCN3YKR026C 918 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 KSH1YNL024C-A 219 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 FSF1YOR271C 984 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 BIM1YER016W 1035 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 YPT1YFL038C 621 nt6.56□□□□□ -1.36 RIP-Chip
PUF2Q12221 GTO3YMR251W 1101 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 RUF23RUF23 254 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 RPL5YPL131W 894 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 KIN1YDR122W 3195 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 SRF1YDL133W 1314 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 AI5_BETAQ0075 1065 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 YDR415CYDR415C 1125 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 TOS2YGR221C 1869 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 HSM3YBR272C 1443 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 NMD5YJR132W 3147 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 SDH4YDR178W 546 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 YHL018WYHL018W 363 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 MDE1YJR024C 735 nt6.54□□□□□ -1.36 RIP-Chip
PUF2Q12221 YJR107WYJR107W 987 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 VPS24YKL041W 675 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 YOR300WYOR300W 309 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 YLL066CYLL066C 3618 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 ADE17YMR120C 1779 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 MSY1YPL097W 1479 nt6.53□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 PRP2YNR011C 2631 nt6.53□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.53□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 FBA1YKL060C 1080 nt6.53□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 RMA1YKL132C 1293 nt6.53□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 GLC8YMR311C 690 nt6.53□□□□□ -1.36
PUF2Q12221 YDR387CYDR387C 1668 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 YOS9YDR057W 1629 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 TOM20YGR082W 552 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 YNL165WYNL165W 1221 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 LDB16YCL005W 771 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 YEN1YER041W 2280 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 ASN2YGR124W 1719 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 SQT1YIR012W 1296 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 REC114YMR133W 1287 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 RNH201YNL072W 924 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 MRPL10YNL284C 969 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 ADH5YBR145W 1056 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 EDC3YEL015W 1656 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 CCC2YDR270W 3015 nt6.51□□□□□ -1.37 RIP-Chip
PUF2Q12221 CIR2YOR356W 1896 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 DPH5YLR172C 903 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 FPR3YML074C 1236 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 AVO2YMR068W 1281 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 DSF1YEL070W 1509 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 PPT1YGR123C 1542 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 YNR073CYNR073C 1509 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 ACO1YLR304C 2337 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 THI2YBR240C 1353 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 HVG1YER039C 750 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 ECM31YBR176W 939 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 RVB2YPL235W 1416 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 YHC3YJL059W 1227 nt6.48□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 YKR032WYKR032W 315 nt6.48□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 PSR2YLR019W 1194 nt6.48□□□□□ -1.37 RIP-Chip
PUF2Q12221 YLR312CYLR312C 1197 nt6.48□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.47□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 ICL2YPR006C 1728 nt6.47□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 PRY3YJL078C 2646 nt6.46□□□□□ -1.37
PUF2Q12221 AMD2YDR242W 1650 nt6.46□□□□□ -1.37 RIP-Chip
PUF2Q12221 BNS1YGR230W 414 nt6.46□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 MEH1YKR007W 555 nt6.46□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 ATG17YLR423C 1254 nt6.46□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 SCS7YMR272C 1155 nt6.46□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt6.46□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 PPS1YBR276C 2424 nt6.46□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 VTS1YOR359W 1572 nt6.45□□□□□ -1.38 RIP-Chip
PUF2Q12221 PMT3YOR321W 2262 nt6.45□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 RAD59YDL059C 717 nt6.45□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 OPI8YKR035C 642 nt6.45□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 YPL277CYPL277C 1464 nt6.45□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 PRE3YJL001W 648 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 YJR084WYJR084W 1272 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 ERG1YGR175C 1491 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF2Q12221 BUG1YDL099W 1026 nt6.43□□□□□ -1.38
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