Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 MPE1YKL059C 1326 nt6.45□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 TUF1YOR187W 1314 nt6.45□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 MRC1YCL061C 3291 nt6.45□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 KAE1YKR038C 1161 nt6.44□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 YDR514CYDR514C 1452 nt6.44□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 PLB2YMR006C 2121 nt6.43□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.43□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.43□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.43□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.43□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.43□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 OST3YOR085W 1053 nt6.43□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 SLA2YNL243W 2907 nt6.43□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 DEF1YKL054C 2217 nt6.43□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 CST6YIL036W 1764 nt6.43□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 TUB1YML085C 1344 nt6.43□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 PAC2YER007W 1557 nt6.43□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 OXP1YKL215C 3861 nt6.43□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 YMR027WYMR027W 1413 nt6.42□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.42□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 YPR130CYPR130C 408 nt6.41□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 RGD2YFL047W 2145 nt6.41□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 IVY1YDR229W 1362 nt6.41□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 UME1YPL139C 1383 nt6.41□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 DML1YMR211W 1428 nt6.41□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 SRP101YDR292C 1866 nt6.41□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 VPS70YJR126C 2436 nt6.4□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 COX9YDL067C 180 nt6.4□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 PIH1YHR034C 1035 nt6.4□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 TIF2YJL138C 1188 nt6.4□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 TIF1YKR059W 1188 nt6.4□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 GPA2YER020W 1350 nt6.4□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 YML133CYML133C 4125 nt6.4□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 VBA1YMR088C 1689 nt6.39□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 PTK2YJR059W 2457 nt6.39□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 DBP9YLR276C 1785 nt6.39□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 ORM1YGR038W 669 nt6.39□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 DYS1YHR068W 1164 nt6.39□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 BUD20YLR074C 501 nt6.39□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 GET4YOR164C 939 nt6.39□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 PDA1YER178W 1263 nt6.38□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 YPL067CYPL067C 597 nt6.38□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 MKK2YPL140C 1521 nt6.38□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 AMA1YGR225W 1782 nt6.38□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 GUP2YPL189W 1830 nt6.38□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 ASN1YPR145W 1719 nt6.37□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 YPL247CYPL247C 1572 nt6.37□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 PYK2YOR347C 1521 nt6.37□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 PPH22YDL188C 1134 nt6.37□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 URH1YDR400W 1023 nt6.37□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 TRS31YDR472W 852 nt6.37□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 CPA1YOR303W 1236 nt6.37□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 RPO26YPR187W 468 nt6.37□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 DRS1YLL008W 2259 nt6.37□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 ERG7YHR072W 2196 nt6.37□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 TRR2YHR106W 1029 nt6.36□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 CBR1YIL043C 855 nt6.36□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 REC107YJR021C 945 nt6.36□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 NTG2YOL043C 1143 nt6.36□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 RDL2YOR286W 450 nt6.36□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 ENP1YBR247C 1452 nt6.35□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 CHL4YDR254W 1377 nt6.35□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 CIA1YDR267C 993 nt6.35□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 RPL31BYLR406C 342 nt6.35□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 SPG5YMR191W 1122 nt6.35□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 YPQ1YOL092W 927 nt6.35□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 MBF1YOR298C-A 456 nt6.35□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 ROG3YFR022W 2202 nt6.35□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.34□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 NCS6YGL211W 1080 nt6.34□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 CYS3YAL012W 1185 nt6.34□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 YNR005CYNR005C 405 nt6.34□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 RPS28AYOR167C 204 nt6.34□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 snR30snR30 606 nt6.34□□□□□ -1.39
NFI1Q12216 NAF1YNL124W 1479 nt6.34□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 VPS1YKR001C 2115 nt6.34□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 PPM2YOL141W 2088 nt6.34□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 PEX31YGR004W 1389 nt6.33□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 NPA3YJR072C 1158 nt6.33□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 PTH2YBL057C 627 nt6.33□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 YNL165WYNL165W 1221 nt6.33□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 HTZ1YOL012C 405 nt6.33□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 EIS1YMR031C 2532 nt6.32□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 YJL144WYJL144W 315 nt6.32□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 PRS4YBL068W 981 nt6.32□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 YCL049CYCL049C 939 nt6.32□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 MIP1YOR330C 3765 nt6.32□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 MAL11YGR289C 1851 nt6.32□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 ATG7YHR171W 1893 nt6.32□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 YDL177CYDL177C 513 nt6.31□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 PTC7YHR076W 1032 nt6.31□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 ECM3YOR092W 1842 nt6.31□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 SET5YHR207C 1581 nt6.31□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 GPI11YDR302W 660 nt6.3□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 MED6YHR058C 888 nt6.3□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 YJL171CYJL171C 1191 nt6.3□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 SES1YDR023W 1389 nt6.3□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 ALD6YPL061W 1503 nt6.3□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 CLB2YPR119W 1476 nt6.29□□□□□ -1.4
NFI1Q12216 YSC83YHR017W 1158 nt6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14 ms