Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 YNL200CYNL200C 741 nt5.23□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 YGR054WYGR054W 1929 nt5.23□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 DMA1YHR115C 1251 nt5.22□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 YRB2YIL063C 984 nt5.22□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 RNH1YMR234W 1047 nt5.22□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 TAF9YMR236W 474 nt5.22□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 MRPS18YNL306W 654 nt5.22□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 YHK8YHR048W 1545 nt5.22□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 CCC2YDR270W 3015 nt5.21□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 PDR18YNR070W 4002 nt5.21□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 VPS61YDR136C 573 nt5.21□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 FMO1YHR176W 1299 nt5.21□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.21□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 AIM20YIL158W 615 nt5.21□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 MDE1YJR024C 735 nt5.21□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 MGM101YJR144W 810 nt5.21□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 LSC1YOR142W 990 nt5.21□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 MOD5YOR274W 1287 nt5.21□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 PGM1YKL127W 1713 nt5.2□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 IMG1YCR046C 510 nt5.2□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 DUS4YLR405W 1104 nt5.2□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 LDB16YCL005W 771 nt5.2□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 ARE2YNR019W 1929 nt5.2□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 PEX3YDR329C 1326 nt5.2□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 YEN1YER041W 2280 nt5.2□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 SAL1YNL083W 1485 nt5.2□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 YHR131CYHR131C 2553 nt5.19□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.19□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 LYS1YIR034C 1122 nt5.19□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 QCR8YJL166W 285 nt5.19□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 PFK2YMR205C 2880 nt5.18□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.18□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 ICS3YJL077C 396 nt5.18□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 YAR064WYAR064W 300 nt5.18□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 IES2YNL215W 963 nt5.18□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 CTF19YPL018W 1110 nt5.18□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 ILV6YCL009C 930 nt5.18□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 CEF1YMR213W 1773 nt5.18□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 PMP3YDR276C 168 nt5.17□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 YDR278CYDR278C 318 nt5.17□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 GCG1YER163C 699 nt5.17□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 DPH5YLR172C 903 nt5.17□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 RAP1YNL216W 2484 nt5.17□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 LCB3YJL134W 1230 nt5.16□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 BSC4YNL269W 396 nt5.16□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 MSO1YNR049C 633 nt5.16□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 YPL136WYPL136W 369 nt5.16□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 CCT8YJL008C 1707 nt5.16□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 DAL4YIR028W 1908 nt5.15□□□□□ -1.58
YHP1Q04116 OPI7YDR360W 435 nt5.15□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 VMA3YEL027W 483 nt5.15□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 CIS3YJL158C 684 nt5.15□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 HMS2YJR147W 1077 nt5.15□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 YKL153WYKL153W 510 nt5.15□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 SRL2YLR082C 1179 nt5.15□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 RUF23RUF23 254 nt5.15□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 SCS22YBL091C-A 528 nt5.15□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 KTR1YOR099W 1182 nt5.15□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 ECM31YBR176W 939 nt5.15□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 TPO3YPR156C 1869 nt5.15□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 PYC2YBR218C 3543 nt5.14□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 COA1YIL157C 594 nt5.14□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 MEH1YKR007W 555 nt5.14□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 IMA5YJL216C 1746 nt5.14□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 RIO1YOR119C 1455 nt5.13□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 VMA2YBR127C 1554 nt5.13□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 MRPL1YDR116C 858 nt5.13□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 OM45YIL136W 1182 nt5.13□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 GPD2YOL059W 1323 nt5.13□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 GPA1YHR005C 1419 nt5.13□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 GPI11YDR302W 660 nt5.12□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 TMT1YER175C 900 nt5.12□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 POR2YIL114C 846 nt5.12□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 YML6YML025C 861 nt5.12□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 GTO3YMR251W 1101 nt5.12□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 PTC4YBR125C 1182 nt5.12□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 RPL21AYBR191W 483 nt5.12□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 YML133CYML133C 4125 nt5.12□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 PAB1YER165W 1734 nt5.11□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 QCR6YFR033C 444 nt5.11□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 RBS1YDL189W 1374 nt5.11□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 ERG8YMR220W 1356 nt5.11□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 AMD2YDR242W 1650 nt5.11□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 YIR042CYIR042C 711 nt5.1□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 TPK1YJL164C 1194 nt5.1□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 YJR154WYJR154W 1041 nt5.1□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 YKR045CYKR045C 552 nt5.1□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 YML083CYML083C 1257 nt5.1□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 CBK1YNL161W 2271 nt5.1□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 DAP1YPL170W 459 nt5.1□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 GAL83YER027C 1254 nt5.09□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 MDH1YKL085W 1005 nt5.09□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 MHT1YLL062C 975 nt5.09□□□□□ -1.59
YHP1Q04116 CSC1YLR241W 2349 nt5.08□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 YTP1YNL237W 1380 nt5.08□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 PPM1YDR435C 987 nt5.08□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.08□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 YLR184WYLR184W 348 nt5.08□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 TSR2YLR435W 618 nt5.08□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 ARA2YMR041C 1008 nt5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.1 ms