Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 DOT1YDR440W 1749 nt6.62□□□□□ -1.35
SEC28P40509 CYS4YGR155W 1524 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC28P40509 MRPL35YDR322W 1104 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC28P40509 YPT1YFL038C 621 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC28P40509 TPK1YJL164C 1194 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC28P40509 RNH1YMR234W 1047 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC28P40509 TOS6YNL300W 309 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC28P40509 HXT15YDL245C 1704 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC28P40509 HXT16YJR158W 1704 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC28P40509 FMP40YPL222W 2067 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC28P40509 YHK8YHR048W 1545 nt6.6□□□□□ -1.35
SEC28P40509 PAP2YOL115W 1755 nt6.6□□□□□ -1.35
SEC28P40509 MEU1YLR017W 1014 nt6.6□□□□□ -1.35
SEC28P40509 RFC4YOL094C 972 nt6.6□□□□□ -1.35
SEC28P40509 SMK1YPR054W 1167 nt6.6□□□□□ -1.35
SEC28P40509 SLA2YNL243W 2907 nt6.6□□□□□ -1.35
SEC28P40509 STT3YGL022W 2157 nt6.59□□□□□ -1.35
SEC28P40509 GUF1YLR289W 1938 nt6.59□□□□□ -1.35
SEC28P40509 MPH3YJR160C 1809 nt6.59□□□□□ -1.35
SEC28P40509 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.58□□□□□ -1.36
SEC28P40509 YRB2YIL063C 984 nt6.58□□□□□ -1.36
SEC28P40509 YKL102CYKL102C 306 nt6.58□□□□□ -1.36
SEC28P40509 MIA40YKL195W 1212 nt6.58□□□□□ -1.36
SEC28P40509 YAR064WYAR064W 300 nt6.58□□□□□ -1.36
SEC28P40509 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.58□□□□□ -1.36
SEC28P40509 IME2YJL106W 1938 nt6.58□□□□□ -1.36
SEC28P40509 MSN2YMR037C 2115 nt6.57□□□□□ -1.36
SEC28P40509 HEM1YDR232W 1647 nt6.57□□□□□ -1.36
SEC28P40509 EMP65YER140W 1671 nt6.56□□□□□ -1.36
SEC28P40509 HSP12YFL014W 330 nt6.56□□□□□ -1.36
SEC28P40509 YJR146WYJR146W 354 nt6.56□□□□□ -1.36
SEC28P40509 SUR7YML052W 909 nt6.56□□□□□ -1.36
SEC28P40509 OGG1YML060W 1131 nt6.56□□□□□ -1.36
SEC28P40509 VMA2YBR127C 1554 nt6.56□□□□□ -1.36
SEC28P40509 YDR401WYDR401W 564 nt6.55□□□□□ -1.36
SEC28P40509 ASF1YJL115W 840 nt6.55□□□□□ -1.36
SEC28P40509 YBR113WYBR113W 483 nt6.55□□□□□ -1.36
SEC28P40509 CRH1YGR189C 1524 nt6.55□□□□□ -1.36
SEC28P40509 CTF8YHR191C 402 nt6.54□□□□□ -1.36
SEC28P40509 TAF9YMR236W 474 nt6.54□□□□□ -1.36
SEC28P40509 RUF23RUF23 254 nt6.54□□□□□ -1.36
SEC28P40509 PUS4YNL292W 1212 nt6.54□□□□□ -1.36
SEC28P40509 ARP3YJR065C 1350 nt6.54□□□□□ -1.36
SEC28P40509 RSC2YLR357W 2670 nt6.53□□□□□ -1.36
SEC28P40509 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.53□□□□□ -1.36
SEC28P40509 FBA1YKL060C 1080 nt6.53□□□□□ -1.36
SEC28P40509 YKL077WYKL077W 1179 nt6.53□□□□□ -1.36
SEC28P40509 YNL165WYNL165W 1221 nt6.53□□□□□ -1.36
SEC28P40509 MRPL23YOR150W 492 nt6.53□□□□□ -1.36
SEC28P40509 DFR1YOR236W 636 nt6.53□□□□□ -1.36
SEC28P40509 CCC2YDR270W 3015 nt6.52□□□□□ -1.36
SEC28P40509 LCL3YGL085W 825 nt6.52□□□□□ -1.37
SEC28P40509 TIF2YJL138C 1188 nt6.52□□□□□ -1.37
SEC28P40509 TIF1YKR059W 1188 nt6.52□□□□□ -1.37
SEC28P40509 LSC1YOR142W 990 nt6.52□□□□□ -1.37
SEC28P40509 YPL257WYPL257W 582 nt6.52□□□□□ -1.37
SEC28P40509 FAL1YDR021W 1200 nt6.51□□□□□ -1.37
SEC28P40509 FMO1YHR176W 1299 nt6.51□□□□□ -1.37
SEC28P40509 YNL120CYNL120C 486 nt6.51□□□□□ -1.37
SEC28P40509 MRPS18YNL306W 654 nt6.51□□□□□ -1.37
SEC28P40509 OST3YOR085W 1053 nt6.51□□□□□ -1.37
SEC28P40509 ECM38YLR299W 1983 nt6.51□□□□□ -1.37
SEC28P40509 YBR284WYBR284W 2394 nt6.51□□□□□ -1.37
SEC28P40509 PEX3YDR329C 1326 nt6.5□□□□□ -1.37
SEC28P40509 LYS1YIR034C 1122 nt6.5□□□□□ -1.37
SEC28P40509 BDF2YDL070W 1917 nt6.5□□□□□ -1.37
SEC28P40509 SKY1YMR216C 2229 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC28P40509 MSY1YPL097W 1479 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC28P40509 SES1YDR023W 1389 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC28P40509 THI2YBR240C 1353 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC28P40509 IRS4YKR019C 1848 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC28P40509 RPP1YHR062C 882 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC28P40509 SQT1YIR012W 1296 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC28P40509 PMT3YOR321W 2262 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC28P40509 TKL2YBR117C 2046 nt6.49□□□□□ -1.37
SEC28P40509 YDL023CYDL023C 321 nt6.48□□□□□ -1.37
SEC28P40509 VMA3YEL027W 483 nt6.48□□□□□ -1.37
SEC28P40509 TFB4YPR056W 1017 nt6.48□□□□□ -1.37
SEC28P40509 SAL1YNL083W 1485 nt6.47□□□□□ -1.37
SEC28P40509 ORM1YGR038W 669 nt6.47□□□□□ -1.37
SEC28P40509 AIM33YML087C 939 nt6.47□□□□□ -1.37
SEC28P40509 MIP1YOR330C 3765 nt6.47□□□□□ -1.37
SEC28P40509 HXK2YGL253W 1461 nt6.47□□□□□ -1.37
SEC28P40509 NOG2YNR053C 1461 nt6.47□□□□□ -1.37
SEC28P40509 HIS7YBR248C 1659 nt6.46□□□□□ -1.37
SEC28P40509 KNS1YLL019C 2214 nt6.46□□□□□ -1.38
SEC28P40509 HXT2YMR011W 1626 nt6.46□□□□□ -1.38
SEC28P40509 HXT17YNR072W 1695 nt6.45□□□□□ -1.38
SEC28P40509 UTR2YEL040W 1404 nt6.45□□□□□ -1.38
SEC28P40509 GCG1YER163C 699 nt6.45□□□□□ -1.38
SEC28P40509 COX5AYNL052W 462 nt6.45□□□□□ -1.38
SEC28P40509 LDB16YCL005W 771 nt6.45□□□□□ -1.38
SEC28P40509 OM45YIL136W 1182 nt6.44□□□□□ -1.38
SEC28P40509 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.44□□□□□ -1.38
SEC28P40509 AIM24YJR080C 1185 nt6.44□□□□□ -1.38
SEC28P40509 ENP1YBR247C 1452 nt6.43□□□□□ -1.38
SEC28P40509 IMG1YCR046C 510 nt6.43□□□□□ -1.38
SEC28P40509 MDE1YJR024C 735 nt6.43□□□□□ -1.38
SEC28P40509 DID2YKR035W-A 615 nt6.43□□□□□ -1.38
SEC28P40509 YLR123CYLR123C 330 nt6.43□□□□□ -1.38
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