Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD11P31277 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXD11P31277 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD11P31277 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD11P31277 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms