Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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