Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEF1

Gramd1a, GRAM domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd1aQ8VEF1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gramd1aQ8VEF1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gramd1aQ8VEF1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gramd1aQ8VEF1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gramd1aQ8VEF1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gramd1aQ8VEF1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gramd1aQ8VEF1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gramd1aQ8VEF1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gramd1aQ8VEF1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gramd1aQ8VEF1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gramd1aQ8VEF1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gramd1aQ8VEF1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gramd1aQ8VEF1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gramd1aQ8VEF1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gramd1aQ8VEF1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms