Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YCR061WYCR061W 1896 nt6.75□□□□□ -1.33 RIP-Chip
PUF2Q12221 YRB2YIL063C 984 nt6.74□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 MHT1YLL062C 975 nt6.74□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 RFS1YBR052C 633 nt6.74□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 OSW2YLR054C 2175 nt6.74□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 SMC5YOL034W 3282 nt6.74□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 HDA1YNL021W 2121 nt6.73□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 YDR187CYDR187C 519 nt6.73□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 IRC11YOR013W 471 nt6.73□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 PPM2YOL141W 2088 nt6.73□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 STT3YGL022W 2157 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 SLA2YNL243W 2907 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 DID2YKR035W-A 615 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 CDC1YDR182W 1476 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 AQR1YNL065W 1761 nt6.72□□□□□ -1.33 RIP-Chip
PUF2Q12221 YKR023WYKR023W 1593 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 YAR064WYAR064W 300 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 CCT3YJL014W 1605 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 MCH2YKL221W 1422 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 MIP1YOR330C 3765 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 HIS1YER055C 894 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 IMD1YAR073W 1212 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 ARC35YNR035C 1029 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 YBR027CYBR027C 333 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 HBN1YCL026C-B 582 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 YBR241CYBR241C 1467 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 YHK8YHR048W 1545 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 PAC10YGR078C 600 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 REG2YBR050C 1017 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 CCT8YJL008C 1707 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 CDC13YDL220C 2775 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 HEM2YGL040C 1029 nt6.68□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 ATO2YNR002C 849 nt6.68□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 TAE1YBR261C 699 nt6.68□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 KDX1YKL161C 1302 nt6.68□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 GPH1YPR160W 2709 nt6.68□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 COX10YPL172C 1389 nt6.68□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 LCP5YER127W 1074 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 CUP2YGL166W 678 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 SPG1YGR236C 288 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 YLR463CYLR463C 552 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 HHY1YEL059W 309 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 ATG36YJL185C 882 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 IDP3YNL009W 1263 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 TAH11YJR046W 1815 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 GSH1YJL101C 2037 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 ATG22YCL038C 1587 nt6.65□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 VMA3YEL027W 483 nt6.65□□□□□ -1.34 RIP-Chip
PUF2Q12221 PUS5YLR165C 765 nt6.65□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 YMR122CYMR122C 375 nt6.65□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 RFC4YOL094C 972 nt6.65□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 DFR1YOR236W 636 nt6.65□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 CTF19YPL018W 1110 nt6.65□□□□□ -1.34
PUF2Q12221 RRP9YPR137W 1722 nt6.64□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 CYB2YML054C 1776 nt6.64□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 YJR146WYJR146W 354 nt6.64□□□□□ -1.35 RIP-Chip
PUF2Q12221 YML018CYML018C 1182 nt6.64□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 YNR014WYNR014W 639 nt6.64□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 MSO1YNR049C 633 nt6.64□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 TDH2YJR009C 999 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 UIP5YKR044W 1332 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 YLR122CYLR122C 378 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 YPL257WYPL257W 582 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 SGF29YCL010C 780 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 PEX31YGR004W 1389 nt6.62□□□□□ -1.35 RIP-Chip
PUF2Q12221 TFG2YGR005C 1203 nt6.62□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 MSP1YGR028W 1089 nt6.62□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 MPC2YHR162W 390 nt6.62□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 ARE2YNR019W 1929 nt6.62□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 ZWF1YNL241C 1518 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 EDE1YBL047C 4146 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 SGV1YPR161C 1974 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 YGR054WYGR054W 1929 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 FAL1YDR021W 1200 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 FYV1YDR024W 486 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 LYS1YIR034C 1122 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF2Q12221 NTG1YAL015C 1200 nt6.61□□□□□ -1.35
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