Protein–RNA interactions for Protein: Q08723

RPN8, 26S proteasome regulatory subunit RPN8, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN8Q08723 CRH1YGR189C 1524 nt6.68□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 TPK1YJL164C 1194 nt6.68□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 YOL099CYOL099C 492 nt6.68□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 ILV6YCL009C 930 nt6.68□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 YBR284WYBR284W 2394 nt6.68□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 KNS1YLL019C 2214 nt6.68□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 YDR387CYDR387C 1668 nt6.68□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 AVO2YMR068W 1281 nt6.67□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 NTG2YOL043C 1143 nt6.67□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 NME1NME1 340 nt6.67□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 YPR127WYPR127W 1038 nt6.67□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 YPR204WYPR204W 3099 nt6.67□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 ARG81YML099C 2643 nt6.66□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 RPL5YPL131W 894 nt6.66□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 CEF1YMR213W 1773 nt6.66□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 ISC1YER019W 1434 nt6.66□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 DAL4YIR028W 1908 nt6.66□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 PPH22YDL188C 1134 nt6.65□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 MIX17YMR002W 471 nt6.65□□□□□ -1.34
RPN8Q08723 TKL2YBR117C 2046 nt6.65□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 NUP49YGL172W 1419 nt6.65□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 NOG2YNR053C 1461 nt6.65□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 RAP1YNL216W 2484 nt6.65□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 YLL056CYLL056C 897 nt6.64□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 ERG27YLR100W 1044 nt6.64□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 VBA5YKR105C 1749 nt6.64□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 RGD2YFL047W 2145 nt6.64□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 BIM1YER016W 1035 nt6.63□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 YUR1YJL139C 1287 nt6.63□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 YLL058WYLL058W 1728 nt6.62□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 HXT2YMR011W 1626 nt6.62□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 MSG5YNL053W 1470 nt6.62□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 OM45YIL136W 1182 nt6.62□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 MIP1YOR330C 3765 nt6.62□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 CTA1YDR256C 1548 nt6.61□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 QCR6YFR033C 444 nt6.61□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 DYS1YHR068W 1164 nt6.61□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 SCS7YMR272C 1155 nt6.61□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 DLD1YDL174C 1764 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 DMC1YER179W 1005 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 LSC1YOR142W 990 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 YBR113WYBR113W 483 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 CYC8YBR112C 2901 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 HIS1YER055C 894 nt6.59□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt6.59□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 YMR122CYMR122C 375 nt6.59□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 YBL112CYBL112C 318 nt6.59□□□□□ -1.35
RPN8Q08723 PEX31YGR004W 1389 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 ERG8YMR220W 1356 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 RNH1YMR234W 1047 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 YMR252CYMR252C 405 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 RNH201YNL072W 924 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 YGL102CYGL102C 429 nt6.57□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 THR1YHR025W 1074 nt6.57□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.57□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 RIO1YOR119C 1455 nt6.57□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 PAC2YER007W 1557 nt6.57□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 RRP9YPR137W 1722 nt6.56□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 DPH5YLR172C 903 nt6.56□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 YNL092WYNL092W 1203 nt6.56□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 GEF1YJR040W 2340 nt6.56□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 GPA1YHR005C 1419 nt6.56□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 CSC1YLR241W 2349 nt6.55□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 PTC7YHR076W 1032 nt6.55□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 PEX13YLR191W 1161 nt6.55□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 OSW2YLR054C 2175 nt6.55□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 SKI2YLR398C 3864 nt6.54□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 TUF1YOR187W 1314 nt6.54□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.54□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 TDH2YJR009C 999 nt6.54□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 SWD1YAR003W 1281 nt6.54□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 YLR463CYLR463C 552 nt6.54□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 FSF1YOR271C 984 nt6.54□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 EFT2YDR385W 2529 nt6.54□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 EFT1YOR133W 2529 nt6.54□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 PRI1YIR008C 1230 nt6.53□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 ICP55YER078C 1536 nt6.53□□□□□ -1.36
RPN8Q08723 HPT1YDR399W 666 nt6.52□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 AIM33YML087C 939 nt6.52□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 CDC1YDR182W 1476 nt6.52□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 RGD1YBR260C 2001 nt6.51□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 TRS31YDR472W 852 nt6.51□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.51□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 CUE4YML101C 354 nt6.51□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 MLS1YNL117W 1665 nt6.51□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 MSC3YLR219W 2187 nt6.51□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 RGT2YDL138W 2292 nt6.5□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 LAG2YOL025W 1983 nt6.5□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 YCR049CYCR049C 447 nt6.5□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt6.5□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 SMX3YPR182W 261 nt6.5□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 ACS1YAL054C 2142 nt6.5□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 YIL055CYIL055C 1884 nt6.49□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 CIS3YJL158C 684 nt6.49□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 MHT1YLL062C 975 nt6.49□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 YBR027CYBR027C 333 nt6.49□□□□□ -1.37
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