Protein–RNA interactions for Protein: Q05948

YLR225C, Uncharacterized SVF1-like protein YLR225C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR225CQ05948 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 YGL102CYGL102C 429 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 YKL102CYKL102C 306 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 RSA3YLR221C 663 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 CUE4YML101C 354 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 SCS7YMR272C 1155 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 YAH1YPL252C 519 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 YJL045WYJL045W 1905 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 APM4YOL062C 1476 nt7.55□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 EAF5YEL018W 840 nt7.55□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 MDL2YPL270W 2322 nt7.55□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 YDL172CYDL172C 480 nt7.54□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 SUA5YGL169W 1281 nt7.54□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 MEX67YPL169C 1800 nt7.54□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 ALR1YOL130W 2580 nt7.53□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 YKR045CYKR045C 552 nt7.53□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 AVL9YLR114C 2295 nt7.53□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 TOM71YHR117W 1920 nt7.52□□□□□ -1.2
YLR225CQ05948 ISY1YJR050W 708 nt7.52□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 MOG1YJR074W 657 nt7.52□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 DUS3YLR401C 2007 nt7.51□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 SNF7YLR025W 723 nt7.51□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 RNH1YMR234W 1047 nt7.51□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 RPL43AYPR043W 279 nt7.51□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 snR34snR34 203 nt7.51□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 UIP5YKR044W 1332 nt7.51□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 HBS1YKR084C 1836 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 IVY1YDR229W 1362 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 GPA2YER020W 1350 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 WHI4YDL224C 1950 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 CKB1YGL019W 837 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 SYF2YGR129W 648 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 YJR115WYJR115W 510 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 YMR114CYMR114C 1107 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 EMP65YER140W 1671 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 GDA1YEL042W 1557 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 GPI18YBR004C 1302 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 DSF1YEL070W 1509 nt7.49□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 YNR073CYNR073C 1509 nt7.49□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 EGD2YHR193C 525 nt7.49□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 PRI1YIR008C 1230 nt7.49□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 YNL194CYNL194C 906 nt7.49□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 CSL4YNL232W 879 nt7.49□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 RCF2YNR018W 675 nt7.49□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 MIM1YOL026C 342 nt7.49□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 PRP40YKL012W 1752 nt7.48□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 SNU66YOR308C 1764 nt7.48□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 MAD2YJL030W 591 nt7.48□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 AFG3YER017C 2286 nt7.48□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 PHA2YNL316C 1005 nt7.47□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 PFS2YNL317W 1398 nt7.46□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 LEO1YOR123C 1395 nt7.46□□□□□ -1.21
YLR225CQ05948 NDJ1YOL104C 1059 nt7.46□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 SMX3YPR182W 261 nt7.46□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 GFA1YKL104C 2154 nt7.46□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 RRP46YGR095C 672 nt7.45□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 ELA1YNL230C 1140 nt7.45□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 CLB4YLR210W 1383 nt7.45□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 DON1YDR273W 1098 nt7.44□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 ERG27YLR100W 1044 nt7.44□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 YET2YMR040W 483 nt7.44□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 RDR1YOR380W 1641 nt7.44□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 YCR099CYCR099C 468 nt7.43□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 TIM22YDL217C 624 nt7.43□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 YAL045CYAL045C 309 nt7.43□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 DBR1YKL149C 1218 nt7.43□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 MRI1YPR118W 1236 nt7.43□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 RTC2YBR147W 891 nt7.43□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 ISR1YPR106W 1332 nt7.43□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 DUR3YHL016C 2208 nt7.43□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 snR82snR82 268 nt7.42□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 MMS2YGL087C 414 nt7.42□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 MPC2YHR162W 390 nt7.42□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 MTQ1YNL063W 945 nt7.42□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 YNL200CYNL200C 741 nt7.42□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 YLR173WYLR173W 1827 nt7.41□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 YDR327WYDR327W 327 nt7.41□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 HVG1YER039C 750 nt7.41□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 PTC7YHR076W 1032 nt7.41□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 YKL077WYKL077W 1179 nt7.41□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 SUR7YML052W 909 nt7.41□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 NSG2YNL156C 900 nt7.41□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 PMT1YDL095W 2454 nt7.4□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 SIT4YDL047W 936 nt7.4□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 YGR291CYGR291C 222 nt7.4□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.4□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 SPC24YMR117C 642 nt7.4□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 MSO1YNR049C 633 nt7.4□□□□□ -1.22
YLR225CQ05948 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.1 ms