Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 YGL102CYGL102C 429 nt5.4□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 CUE4YML101C 354 nt5.4□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 SEC62YPL094C 825 nt5.4□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 YPR076WYPR076W 375 nt5.4□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 ADH5YBR145W 1056 nt5.4□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 MSC3YLR219W 2187 nt5.4□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 CLN1YMR199W 1641 nt5.4□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 BIO3YNR058W 1443 nt5.4□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 GLN3YER040W 2193 nt5.39□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 LDB7YBL006C 543 nt5.39□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 COX5AYNL052W 462 nt5.39□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 MPH3YJR160C 1809 nt5.39□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 COQ1YBR003W 1422 nt5.39□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 PMT3YOR321W 2262 nt5.39□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 YOL046CYOL046C 675 nt5.38□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 FIT2YOR382W 462 nt5.38□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 NUP49YGL172W 1419 nt5.38□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 DOT1YDR440W 1749 nt5.37□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 YPT1YFL038C 621 nt5.37□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 MIA40YKL195W 1212 nt5.37□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 TMA46YOR091W 1038 nt5.37□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 YOR111WYOR111W 699 nt5.37□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 ACO1YLR304C 2337 nt5.37□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 PHO3YBR092C 1404 nt5.37□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 CYS4YGR155W 1524 nt5.37□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 EMP65YER140W 1671 nt5.37□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 CIR2YOR356W 1896 nt5.37□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 SWD1YAR003W 1281 nt5.36□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 COX15YER141W 1461 nt5.36□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 PPM2YOL141W 2088 nt5.36□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 SES1YDR023W 1389 nt5.35□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 EDE1YBL047C 4146 nt5.35□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 PPH21YDL134C 1110 nt5.35□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 HED1YDR014W-A 489 nt5.35□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 FPR2YDR519W 408 nt5.35□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 FBA1YKL060C 1080 nt5.35□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 DID2YKR035W-A 615 nt5.35□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 YLL056CYLL056C 897 nt5.35□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 YLR312CYLR312C 1197 nt5.35□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 AGP2YBR132C 1791 nt5.34□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 AGX1YFL030W 1158 nt5.34□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 LIA1YJR070C 978 nt5.34□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 HOC1YJR075W 1191 nt5.34□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 YKL077WYKL077W 1179 nt5.34□□□□□ -1.55
YHP1Q04116 DAL7YIR031C 1665 nt5.34□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 PRP2YNR011C 2631 nt5.33□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 GPD1YDL022W 1176 nt5.33□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 MSY1YPL097W 1479 nt5.32□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 UTR2YEL040W 1404 nt5.32□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 HSM3YBR272C 1443 nt5.32□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 SQT1YIR012W 1296 nt5.32□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.32□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 VTS1YOR359W 1572 nt5.32□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 ECM30YLR436C 3825 nt5.32□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 ADE17YMR120C 1779 nt5.32□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 ERG12YMR208W 1332 nt5.31□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 BIM1YER016W 1035 nt5.31□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 YNL120CYNL120C 486 nt5.31□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 MRPL19YNL185C 477 nt5.31□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.31□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 ASR1YPR093C 867 nt5.31□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 TOS2YGR221C 1869 nt5.3□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 THI2YBR240C 1353 nt5.3□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 NTE1YML059C 5040 nt5.3□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 MRPL35YDR322W 1104 nt5.3□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 ASN2YGR124W 1719 nt5.3□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 YOS9YDR057W 1629 nt5.3□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 RPP1YHR062C 882 nt5.29□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 ATG36YJL185C 882 nt5.29□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 YLR123CYLR123C 330 nt5.29□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 RFC4YOL094C 972 nt5.29□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 MRPL23YOR150W 492 nt5.29□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 YPL257WYPL257W 582 nt5.29□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 ISC1YER019W 1434 nt5.29□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 COX10YPL172C 1389 nt5.29□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 YJR146WYJR146W 354 nt5.28□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 AIM33YML087C 939 nt5.28□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 FMP40YPL222W 2067 nt5.28□□□□□ -1.56
YHP1Q04116 YUR1YJL139C 1287 nt5.27□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 PEX13YLR191W 1161 nt5.27□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 YNL092WYNL092W 1203 nt5.27□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 NMD5YJR132W 3147 nt5.27□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 CRP1YHR146W 1398 nt5.27□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 AIM24YJR080C 1185 nt5.26□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 RKI1YOR095C 777 nt5.26□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 AVT4YNL101W 2142 nt5.26□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 KNS1YLL019C 2214 nt5.25□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 KSH1YNL024C-A 219 nt5.25□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 Q0010Q0010 387 nt5.25□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 SGE1YPR198W 1632 nt5.25□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 FAL1YDR021W 1200 nt5.24□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 GTT3YEL017W 1014 nt5.24□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 LCL3YGL085W 825 nt5.24□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 SRY1YKL218C 981 nt5.24□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 COQ3YOL096C 939 nt5.24□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 GEF1YJR040W 2340 nt5.24□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 CRH1YGR189C 1524 nt5.23□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 ASF1YJL115W 840 nt5.23□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 YKL102CYKL102C 306 nt5.23□□□□□ -1.57
YHP1Q04116 OGG1YML060W 1131 nt5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.1 ms