Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKR1Q03880 EMW1YNL313C 2715 nt5.33□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 JIP4YDR475C 2631 nt5.33□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 CRP1YHR146W 1398 nt5.33□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 SPS22YCL048W 1392 nt5.33□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 PET18YCR020C 648 nt5.33□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 TIM22YDL217C 624 nt5.33□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 CDC11YJR076C 1248 nt5.33□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 MOD5YOR274W 1287 nt5.33□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 RDL2YOR286W 450 nt5.33□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 RPL43AYPR043W 279 nt5.33□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 ASN1YPR145W 1719 nt5.31□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 CMR1YDL156W 1569 nt5.31□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 DMC1YER179W 1005 nt5.31□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 YJL160CYJL160C 864 nt5.31□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 GEP5YLR091W 882 nt5.31□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 YNL017CYNL017C 339 nt5.31□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 YNL092WYNL092W 1203 nt5.31□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 PYK2YOR347C 1521 nt5.31□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 SPS1YDR523C 1473 nt5.31□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 GPB2YAL056W 2643 nt5.3□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 TKL1YPR074C 2043 nt5.3□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 PSA1YDL055C 1086 nt5.3□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 YIL168WYIL168W 384 nt5.3□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 CPA1YOR303W 1236 nt5.3□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 GUF1YLR289W 1938 nt5.3□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 SPR1YOR190W 1338 nt5.29□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 YML133CYML133C 4125 nt5.29□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 YOL036WYOL036W 2286 nt5.29□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 STS1YIR011C 960 nt5.29□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 YFL042CYFL042C 2025 nt5.29□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 UTR2YEL040W 1404 nt5.29□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 LAT1YNL071W 1449 nt5.29□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 FMP40YPL222W 2067 nt5.28□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 VPS5YOR069W 2028 nt5.28□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 HEM1YDR232W 1647 nt5.28□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 YMR279CYMR279C 1623 nt5.28□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 YDR415CYDR415C 1125 nt5.28□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 YJL213WYJL213W 996 nt5.28□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 RPS28AYOR167C 204 nt5.28□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 PAP2YOL115W 1755 nt5.28□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 IVY1YDR229W 1362 nt5.28□□□□□ -1.56
PKR1Q03880 TEL2YGR099W 2067 nt5.27□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 GPI11YDR302W 660 nt5.27□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 GDA1YEL042W 1557 nt5.27□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 TDH1YJL052W 999 nt5.27□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 CPT1YNL130C 1182 nt5.27□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 ERV2YPR037C 591 nt5.27□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 YBR113WYBR113W 483 nt5.27□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 PYC2YBR218C 3543 nt5.27□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 YDR476CYDR476C 675 nt5.26□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 YMR007WYMR007W 381 nt5.26□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 IRC11YOR013W 471 nt5.26□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 RCR1YBR005W 642 nt5.26□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 PTK2YJR059W 2457 nt5.26□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 AMA1YGR225W 1782 nt5.26□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 CLB2YPR119W 1476 nt5.26□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 NTE1YML059C 5040 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 PPM2YOL141W 2088 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 CHS5YLR330W 2016 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 KEL1YHR158C 3495 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 PET117YER058W 324 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 RHO4YKR055W 876 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 ICT1YLR099C 1185 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 ATP23YNR020C 813 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 MRPS12YNR036C 462 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 SDH8YBR269C 417 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 HSP104YLL026W 2727 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 CHL4YDR254W 1377 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 GEX1YCL073C 1848 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 GEX2YKR106W 1848 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 PDR18YNR070W 4002 nt5.25□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 PNS1YOR161C 1620 nt5.24□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 YCR049CYCR049C 447 nt5.24□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 SKP1YDR328C 585 nt5.24□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 RAD51YER095W 1203 nt5.24□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 SOH1YGL127C 384 nt5.24□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 CCW12YLR110C 402 nt5.24□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 YNL108CYNL108C 813 nt5.24□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 CRZ1YNL027W 2037 nt5.24□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 PRP24YMR268C 1335 nt5.23□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 OSM1YJR051W 1506 nt5.23□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 GPT2YKR067W 2232 nt5.23□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 VPS70YJR126C 2436 nt5.23□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 YJL064WYJL064W 396 nt5.23□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 YLR312CYLR312C 1197 nt5.23□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 XBP1YIL101C 1944 nt5.23□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 CDC16YKL022C 2523 nt5.22□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 NFS1YCL017C 1494 nt5.22□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 HRB1YNL004W 1365 nt5.22□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 YCP4YCR004C 744 nt5.22□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 YSC83YHR017W 1158 nt5.22□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 DMA1YHR115C 1251 nt5.22□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 PAU19YMR325W 375 nt5.22□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 SET5YHR207C 1581 nt5.21□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 MRC1YCL061C 3291 nt5.21□□□□□ -1.57
PKR1Q03880 FAT3YKL187C 2253 nt5.21□□□□□ -1.58
PKR1Q03880 MRPL1YDR116C 858 nt5.21□□□□□ -1.58
PKR1Q03880 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.21□□□□□ -1.58
PKR1Q03880 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.21□□□□□ -1.58
PKR1Q03880 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.4 ms