Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 PTH2YBL057C 627 nt6.9□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 YNR005CYNR005C 405 nt6.9□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 HBN1YCL026C-B 582 nt6.9□□□□□ -1.3
YNL058CP53947 VMA2YBR127C 1554 nt6.9□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 TPK1YJL164C 1194 nt6.89□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.89□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 CST26YBR042C 1194 nt6.89□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 HXK2YGL253W 1461 nt6.89□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 TAH11YJR046W 1815 nt6.88□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 UME1YPL139C 1383 nt6.88□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 HOG1YLR113W 1308 nt6.88□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 HTZ1YOL012C 405 nt6.88□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 OPT1YJL212C 2400 nt6.88□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 ASN1YPR145W 1719 nt6.87□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 YMR034CYMR034C 1305 nt6.87□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 CYS3YAL012W 1185 nt6.87□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 IME2YJL106W 1938 nt6.87□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 SNU71YGR013W 1863 nt6.87□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 PDA1YER178W 1263 nt6.86□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.86□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 AIM46YHR199C 933 nt6.86□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 COX16YJL003W 357 nt6.86□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 ATG17YLR423C 1254 nt6.86□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 NTG2YOL043C 1143 nt6.86□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 PAC2YER007W 1557 nt6.86□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 CYC8YBR112C 2901 nt6.86□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 REC107YJR021C 945 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 RPL31BYLR406C 342 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 MRPL19YNL185C 477 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 YPQ1YOL092W 927 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 snR30snR30 606 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 BUD9YGR041W 1644 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 FHN1YGR131W 525 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 YLR162WYLR162W 357 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 OPI11YPR044C 354 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL058CP53947 IMA2YOL157C 1770 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 YGL102CYGL102C 429 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 CBR1YIL043C 855 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 ATG36YJL185C 882 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 RRN10YBL025W 438 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 ERG10YPL028W 1197 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 SMK1YPR054W 1167 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 EMP65YER140W 1671 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 PCS60YBR222C 1632 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 TFC6YDR362C 2019 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 ATG22YCL038C 1587 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 YDL177CYDL177C 513 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 MBF1YOR298C-A 456 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 SMX3YPR182W 261 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 EDC2YER035W 438 nt6.81□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 CUE4YML101C 354 nt6.81□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 PRE5YMR314W 705 nt6.81□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 IDP3YNL009W 1263 nt6.81□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 TFB4YPR056W 1017 nt6.81□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 ADH5YBR145W 1056 nt6.81□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 POP1YNL221C 2628 nt6.81□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 CLN1YMR199W 1641 nt6.8□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 SRP101YDR292C 1866 nt6.8□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 PUP2YGR253C 783 nt6.8□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 GSH1YJL101C 2037 nt6.8□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 GCN3YKR026C 918 nt6.8□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 YLL056CYLL056C 897 nt6.8□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 PPM2YOL141W 2088 nt6.8□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 HXT2YMR011W 1626 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 RGD2YFL047W 2145 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 HED1YDR014W-A 489 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 SPG5YMR191W 1122 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 YCL049CYCL049C 939 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 NAF1YNL124W 1479 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 ALT2YDR111C 1524 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 PXL1YKR090W 2121 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 YOX1YML027W 1158 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 YNR014WYNR014W 639 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 CCT3YJL014W 1605 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 CHL4YDR254W 1377 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 GLN3YER040W 2193 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 YLL066CYLL066C 3618 nt6.77□□□□□ -1.32
YNL058CP53947 SWP1YMR149W 861 nt6.77□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 DFR1YOR236W 636 nt6.77□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 RDL2YOR286W 450 nt6.77□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 RPL5YPL131W 894 nt6.77□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 DYS1YHR068W 1164 nt6.76□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 YJL144WYJL144W 315 nt6.76□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 YJR107WYJR107W 987 nt6.76□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 PEX31YGR004W 1389 nt6.76□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 APE4YHR113W 1473 nt6.76□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 PPH22YDL188C 1134 nt6.75□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 YPR076WYPR076W 375 nt6.75□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 GPT2YKR067W 2232 nt6.74□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 THI4YGR144W 981 nt6.74□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 YSC83YHR017W 1158 nt6.74□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 FCY22YER060W-A 1593 nt6.74□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 ICP55YER078C 1536 nt6.73□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 YDR415CYDR415C 1125 nt6.73□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 YHM2YMR241W 945 nt6.73□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 TMA46YOR091W 1038 nt6.73□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 BDF2YDL070W 1917 nt6.73□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 LAT1YNL071W 1449 nt6.73□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 YHR020WYHR020W 2067 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 YDL023CYDL023C 321 nt6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.5 ms