Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 YSC83YHR017W 1158 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 REC107YJR021C 945 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 ADE1YAR015W 921 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 HEM1YDR232W 1647 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 SKI2YLR398C 3864 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 PLB2YMR006C 2121 nt6.23□□□□□ -1.41
DDI1P40087 SGV1YPR161C 1974 nt6.22□□□□□ -1.41
DDI1P40087 ATG36YJL185C 882 nt6.22□□□□□ -1.41
DDI1P40087 SPG5YMR191W 1122 nt6.22□□□□□ -1.41
DDI1P40087 ERG10YPL028W 1197 nt6.22□□□□□ -1.41
DDI1P40087 PXL1YKR090W 2121 nt6.22□□□□□ -1.41
DDI1P40087 RSA4YCR072C 1548 nt6.21□□□□□ -1.42
DDI1P40087 DPH5YLR172C 903 nt6.21□□□□□ -1.42
DDI1P40087 PMT3YOR321W 2262 nt6.21□□□□□ -1.42
DDI1P40087 YPR204WYPR204W 3099 nt6.21□□□□□ -1.42
DDI1P40087 ARG81YML099C 2643 nt6.2□□□□□ -1.42
DDI1P40087 GET4YOR164C 939 nt6.2□□□□□ -1.42
DDI1P40087 NMT1YLR195C 1368 nt6.19□□□□□ -1.42
DDI1P40087 PPM2YOL141W 2088 nt6.19□□□□□ -1.42
DDI1P40087 DML1YMR211W 1428 nt6.19□□□□□ -1.42
DDI1P40087 DOC1YGL240W 753 nt6.19□□□□□ -1.42
DDI1P40087 ICS3YJL077C 396 nt6.19□□□□□ -1.42
DDI1P40087 NTG2YOL043C 1143 nt6.19□□□□□ -1.42
DDI1P40087 YOR300WYOR300W 309 nt6.19□□□□□ -1.42
DDI1P40087 NME1NME1 340 nt6.19□□□□□ -1.42
DDI1P40087 YHR020WYHR020W 2067 nt6.19□□□□□ -1.42
DDI1P40087 EDE1YBL047C 4146 nt6.18□□□□□ -1.42
DDI1P40087 FBA1YKL060C 1080 nt6.18□□□□□ -1.42
DDI1P40087 RMD9YGL107C 1941 nt6.18□□□□□ -1.42
DDI1P40087 MIP1YOR330C 3765 nt6.17□□□□□ -1.42
DDI1P40087 ALT2YDR111C 1524 nt6.17□□□□□ -1.42
DDI1P40087 YHC3YJL059W 1227 nt6.17□□□□□ -1.42
DDI1P40087 KAE1YKR038C 1161 nt6.17□□□□□ -1.42
DDI1P40087 CCP1YKR066C 1086 nt6.17□□□□□ -1.42
DDI1P40087 YBR113WYBR113W 483 nt6.17□□□□□ -1.42
DDI1P40087 HDA1YNL021W 2121 nt6.17□□□□□ -1.42
DDI1P40087 UTR2YEL040W 1404 nt6.16□□□□□ -1.42
DDI1P40087 CIS3YJL158C 684 nt6.16□□□□□ -1.42
DDI1P40087 AIM3YBR108W 2844 nt6.15□□□□□ -1.42
DDI1P40087 MRPS28YDR337W 861 nt6.15□□□□□ -1.42
DDI1P40087 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.15□□□□□ -1.42
DDI1P40087 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.15□□□□□ -1.42
DDI1P40087 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.15□□□□□ -1.42
DDI1P40087 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.15□□□□□ -1.42
DDI1P40087 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.15□□□□□ -1.42
DDI1P40087 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.15□□□□□ -1.42
DDI1P40087 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.15□□□□□ -1.42
DDI1P40087 RPP1YHR062C 882 nt6.15□□□□□ -1.42
DDI1P40087 MIA40YKL195W 1212 nt6.15□□□□□ -1.42
DDI1P40087 YNR005CYNR005C 405 nt6.15□□□□□ -1.42
DDI1P40087 YPR130CYPR130C 408 nt6.15□□□□□ -1.42
DDI1P40087 THI2YBR240C 1353 nt6.15□□□□□ -1.43
DDI1P40087 TMA46YOR091W 1038 nt6.14□□□□□ -1.43
DDI1P40087 STT3YGL022W 2157 nt6.14□□□□□ -1.43
DDI1P40087 IMA5YJL216C 1746 nt6.13□□□□□ -1.43
DDI1P40087 CCC2YDR270W 3015 nt6.13□□□□□ -1.43
DDI1P40087 PPM1YDR435C 987 nt6.13□□□□□ -1.43
DDI1P40087 PEX13YLR191W 1161 nt6.13□□□□□ -1.43
DDI1P40087 KSH1YNL024C-A 219 nt6.13□□□□□ -1.43
DDI1P40087 SMX3YPR182W 261 nt6.13□□□□□ -1.43
DDI1P40087 RBS1YDL189W 1374 nt6.13□□□□□ -1.43
DDI1P40087 RGT2YDL138W 2292 nt6.13□□□□□ -1.43
DDI1P40087 YGL102CYGL102C 429 nt6.12□□□□□ -1.43
DDI1P40087 CRP1YHR146W 1398 nt6.12□□□□□ -1.43
DDI1P40087 HTZ1YOL012C 405 nt6.12□□□□□ -1.43
DDI1P40087 ESC8YOL017W 2145 nt6.12□□□□□ -1.43
DDI1P40087 YOR268CYOR268C 399 nt6.12□□□□□ -1.43
DDI1P40087 TPO3YPR156C 1869 nt6.11□□□□□ -1.43
DDI1P40087 CIA1YDR267C 993 nt6.11□□□□□ -1.43
DDI1P40087 SQT1YIR012W 1296 nt6.11□□□□□ -1.43
DDI1P40087 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.11□□□□□ -1.43
DDI1P40087 YDR387CYDR387C 1668 nt6.1□□□□□ -1.43
DDI1P40087 GPA1YHR005C 1419 nt6.1□□□□□ -1.43
DDI1P40087 HED1YDR014W-A 489 nt6.1□□□□□ -1.43
DDI1P40087 GPI11YDR302W 660 nt6.1□□□□□ -1.43
DDI1P40087 DUS4YLR405W 1104 nt6.1□□□□□ -1.43
DDI1P40087 DFR1YOR236W 636 nt6.09□□□□□ -1.43
DDI1P40087 MOD5YOR274W 1287 nt6.09□□□□□ -1.43
DDI1P40087 MSY1YPL097W 1479 nt6.09□□□□□ -1.44
DDI1P40087 PEX3YDR329C 1326 nt6.08□□□□□ -1.44
DDI1P40087 PRI1YIR008C 1230 nt6.08□□□□□ -1.44
DDI1P40087 YLR123CYLR123C 330 nt6.08□□□□□ -1.44
DDI1P40087 YLR358CYLR358C 564 nt6.08□□□□□ -1.44
DDI1P40087 YML6YML025C 861 nt6.08□□□□□ -1.44
DDI1P40087 MRPL19YNL185C 477 nt6.08□□□□□ -1.44
DDI1P40087 YML133CYML133C 4125 nt6.07□□□□□ -1.44
DDI1P40087 FUS3YBL016W 1062 nt6.07□□□□□ -1.44
DDI1P40087 YNL120CYNL120C 486 nt6.07□□□□□ -1.44
DDI1P40087 KEL1YHR158C 3495 nt6.07□□□□□ -1.44
DDI1P40087 COQ1YBR003W 1422 nt6.07□□□□□ -1.44
DDI1P40087 PAT1YCR077C 2391 nt6.06□□□□□ -1.44
DDI1P40087 BZZ1YHR114W 1902 nt6.06□□□□□ -1.44
DDI1P40087 COX9YDL067C 180 nt6.06□□□□□ -1.44
DDI1P40087 YLL056CYLL056C 897 nt6.06□□□□□ -1.44
DDI1P40087 RFC4YOL094C 972 nt6.06□□□□□ -1.44
DDI1P40087 SKN1YGR143W 2316 nt6.05□□□□□ -1.44
DDI1P40087 QNS1YHR074W 2145 nt6.05□□□□□ -1.44
DDI1P40087 APE4YHR113W 1473 nt6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.6 ms