Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brs3O54798 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brs3O54798 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brs3O54798 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brs3O54798 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brs3O54798 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brs3O54798 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brs3O54798 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brs3O54798 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brs3O54798 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brs3O54798 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brs3O54798 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brs3O54798 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brs3O54798 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms