Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCSO14618 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCSO14618 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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