Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARGC1BQ86YN6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPARGC1BQ86YN6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms