Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCSO14618 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCSO14618 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCSO14618 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCSO14618 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms