Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PPARGC1BQ86YN6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARGC1BQ86YN6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms