Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc65Q8VHI7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc65Q8VHI7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc65Q8VHI7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc65Q8VHI7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms