Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ggnbp1Q6K1E7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ggnbp1Q6K1E7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ggnbp1Q6K1E7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ggnbp1Q6K1E7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms