Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ltn1Q6A009 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ltn1Q6A009 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ltn1Q6A009 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ltn1Q6A009 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ltn1Q6A009 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ltn1Q6A009 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ltn1Q6A009 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ltn1Q6A009 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Ltn1Q6A009 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ltn1Q6A009 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ltn1Q6A009 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ltn1Q6A009 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ltn1Q6A009 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms