Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 TRR2YHR106W 1029 nt6.61□□□□□ -1.35
RPN6Q12377 PRS4YBL068W 981 nt6.61□□□□□ -1.35
RPN6Q12377 PAC2YER007W 1557 nt6.61□□□□□ -1.35
RPN6Q12377 SLA2YNL243W 2907 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN6Q12377 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN6Q12377 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN6Q12377 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN6Q12377 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN6Q12377 NTG2YOL043C 1143 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN6Q12377 snR30snR30 606 nt6.6□□□□□ -1.35
RPN6Q12377 CIA1YDR267C 993 nt6.59□□□□□ -1.35
RPN6Q12377 PDA1YER178W 1263 nt6.59□□□□□ -1.35
RPN6Q12377 RPL2BYIL018W 765 nt6.59□□□□□ -1.35
RPN6Q12377 HTZ1YOL012C 405 nt6.59□□□□□ -1.35
RPN6Q12377 VBA5YKR105C 1749 nt6.59□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 TRS31YDR472W 852 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 YIP4YGL198W 708 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 YML079WYML079W 606 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 SPG5YMR191W 1122 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 YNR005CYNR005C 405 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 CST26YBR042C 1194 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 SKY1YMR216C 2229 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 RSP5YER125W 2430 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 EMP65YER140W 1671 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 SGE1YPR198W 1632 nt6.58□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 YNR014WYNR014W 639 nt6.57□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 YCL049CYCL049C 939 nt6.57□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 APE4YHR113W 1473 nt6.57□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 CYS3YAL012W 1185 nt6.56□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 REC107YJR021C 945 nt6.56□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 CLN1YMR199W 1641 nt6.56□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 YPL247CYPL247C 1572 nt6.56□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 RGD2YFL047W 2145 nt6.55□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 MET8YBR213W 825 nt6.55□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 PUP2YGR253C 783 nt6.54□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 PTC7YHR076W 1032 nt6.54□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 COX16YJL003W 357 nt6.54□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.54□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 PAB1YER165W 1734 nt6.53□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 PPH22YDL188C 1134 nt6.53□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 NAS6YGR232W 687 nt6.53□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 ECM30YLR436C 3825 nt6.53□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 YLL066CYLL066C 3618 nt6.53□□□□□ -1.36
RPN6Q12377 MRPS28YDR337W 861 nt6.52□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 URH1YDR400W 1023 nt6.52□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 RPL31BYLR406C 342 nt6.52□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 YMR034CYMR034C 1305 nt6.51□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 YLL058WYLL058W 1728 nt6.51□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.51□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 YSC83YHR017W 1158 nt6.51□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 YLR162WYLR162W 357 nt6.51□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 OPI11YPR044C 354 nt6.51□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 YDL177CYDL177C 513 nt6.5□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 CTF8YHR191C 402 nt6.5□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 CBR1YIL043C 855 nt6.5□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 YHR131CYHR131C 2553 nt6.5□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 MIP1YOR330C 3765 nt6.49□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 CBK1YNL161W 2271 nt6.49□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 BDF2YDL070W 1917 nt6.48□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 ECM38YLR299W 1983 nt6.48□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 FPR2YDR519W 408 nt6.48□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 HMS2YJR147W 1077 nt6.48□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 GCN3YKR026C 918 nt6.48□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 OPI8YKR035C 642 nt6.48□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 YOR268CYOR268C 399 nt6.48□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 LAT1YNL071W 1449 nt6.48□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 PEX31YGR004W 1389 nt6.47□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 ARP3YJR065C 1350 nt6.47□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 YGL102CYGL102C 429 nt6.47□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 PRI1YIR008C 1230 nt6.47□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 RPR1RPR1 369 nt6.47□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 RPL5YPL131W 894 nt6.47□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 SMX3YPR182W 261 nt6.47□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 HOG1YLR113W 1308 nt6.47□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 DAL4YIR028W 1908 nt6.46□□□□□ -1.37
RPN6Q12377 FCY22YER060W-A 1593 nt6.46□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 TPK1YJL164C 1194 nt6.46□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 PRE5YMR314W 705 nt6.46□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 IRC11YOR013W 471 nt6.46□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 HIS1YER055C 894 nt6.45□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 HSP12YFL014W 330 nt6.45□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 YOX1YML027W 1158 nt6.45□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 SUR7YML052W 909 nt6.45□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 FIT2YOR382W 462 nt6.45□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 ERG10YPL028W 1197 nt6.45□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 YJL163CYJL163C 1668 nt6.45□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 ICP55YER078C 1536 nt6.45□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 GTT3YEL017W 1014 nt6.44□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 AIM46YHR199C 933 nt6.44□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 YLL056CYLL056C 897 nt6.44□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 SML1YML058W 315 nt6.44□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 YHR020WYHR020W 2067 nt6.44□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 MFG1YDL233W 1377 nt6.44□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 GLN3YER040W 2193 nt6.43□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 DYS1YHR068W 1164 nt6.43□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 MSC3YLR219W 2187 nt6.42□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 NUP49YGL172W 1419 nt6.42□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.42□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.42□□□□□ -1.38
RPN6Q12377 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.42□□□□□ -1.38
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