Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 COX15YER141W 1461 nt7.17□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 SSC1YJR045C 1965 nt7.17□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 MHP1YJL042W 4197 nt7.16□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 FCY22YER060W-A 1593 nt7.16□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 ICL2YPR006C 1728 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 LIA1YJR070C 978 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 DPH5YLR172C 903 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 YPL041CYPL041C 624 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 IRC5YFR038W 2562 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 NUP49YGL172W 1419 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 REC107YJR021C 945 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 LOT6YLR011W 576 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 ASR1YPR093C 867 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 FMP40YPL222W 2067 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 ICP55YER078C 1536 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 HAL5YJL165C 2568 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 BIM1YER016W 1035 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 YGL102CYGL102C 429 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 DLD1YDL174C 1764 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 MSC3YLR219W 2187 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 GPD1YDL022W 1176 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 MRPL35YDR322W 1104 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 RFS1YBR052C 633 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 CIR2YOR356W 1896 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 MSG5YNL053W 1470 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 RPL2BYIL018W 765 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 YLL056CYLL056C 897 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 HEL1YKR017C 1656 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 CRH1YGR189C 1524 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 YOR389WYOR389W 1875 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 PRI1YIR008C 1230 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 MIX17YMR002W 471 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 SPG5YMR191W 1122 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 SMX3YPR182W 261 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 YEN1YER041W 2280 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 TDP1YBR223C 1635 nt7.09□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 VBA5YKR105C 1749 nt7.09□□□□□ -1.27
VPS54Q12071 MRPS28YDR337W 861 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 PTC7YHR076W 1032 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 SRY1YKL218C 981 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 RPL31BYLR406C 342 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 AGP2YBR132C 1791 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 MRPL19YNL185C 477 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 LSC1YOR142W 990 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 YKR023WYKR023W 1593 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 NUP84YDL116W 2181 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 LCL3YGL085W 825 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 SNF4YGL115W 969 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 SEC62YPL094C 825 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 YCR041WYCR041W 333 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 PMP3YDR276C 168 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 SRF1YDL133W 1314 nt7.04□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 CEM1YER061C 1329 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 CBR1YIL043C 855 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 MEU1YLR017W 1014 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS54Q12071 URH1YDR400W 1023 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 AIM20YIL158W 615 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 ASF1YJL115W 840 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 YLR112WYLR112W 420 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 YBR113WYBR113W 483 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 ILV6YCL009C 930 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 SAL1YNL083W 1485 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 VTS1YOR359W 1572 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 ACO1YLR304C 2337 nt7.01□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.01□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 YOR012WYOR012W 414 nt7.01□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 SNT309YPR101W 528 nt7.01□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 TUF1YOR187W 1314 nt7.01□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 SGV1YPR161C 1974 nt7□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 HED1YDR014W-A 489 nt7□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 YKL102CYKL102C 306 nt7□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 AIM2YAL049C 741 nt7□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 DOT1YDR440W 1749 nt7□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 ASN2YGR124W 1719 nt7□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 YCR061WYCR061W 1896 nt6.99□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 TRS31YDR472W 852 nt6.99□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 FMO1YHR176W 1299 nt6.99□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 YKL077WYKL077W 1179 nt6.99□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 TAF9YMR236W 474 nt6.99□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 AMN1YBR158W 1650 nt6.99□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 HDA1YNL021W 2121 nt6.98□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 MRPL28YDR462W 444 nt6.98□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.98□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 YKL153WYKL153W 510 nt6.98□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 YNL092WYNL092W 1203 nt6.98□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 MRPS18YNL306W 654 nt6.97□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 SCS22YBL091C-A 528 nt6.97□□□□□ -1.29
VPS54Q12071 IMG1YCR046C 510 nt6.96□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt6.96□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 SWD1YAR003W 1281 nt6.96□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 YBL112CYBL112C 318 nt6.96□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 YOR300WYOR300W 309 nt6.96□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 YOS9YDR057W 1629 nt6.96□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 YMR034CYMR034C 1305 nt6.96□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 ERG12YMR208W 1332 nt6.96□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 PAC2YER007W 1557 nt6.95□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 OPI7YDR360W 435 nt6.95□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 RBS1YDL189W 1374 nt6.95□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 RQC1YDR333C 2172 nt6.94□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 YDL177CYDL177C 513 nt6.94□□□□□ -1.3
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