Protein–RNA interactions for Protein: Q07657

SHS1, Seventh homolog of septin 1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHS1Q07657 SPE4YLR146C 903 nt7.19□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 AIM34YMR003W 597 nt7.19□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 SEC62YPL094C 825 nt7.19□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 ADE2YOR128C 1716 nt7.18□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 SWD1YAR003W 1281 nt7.18□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 YMR252CYMR252C 405 nt7.18□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 YPL136WYPL136W 369 nt7.18□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 SNU66YOR308C 1764 nt7.18□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 PRB1YEL060C 1908 nt7.17□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.17□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 YKL102CYKL102C 306 nt7.17□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 NME1NME1 340 nt7.17□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 TRS31YDR472W 852 nt7.16□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 SPG1YGR236C 288 nt7.16□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.16□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 DRE2YKR071C 1047 nt7.16□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 LPD1YFL018C 1500 nt7.16□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 RNH1YMR234W 1047 nt7.15□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 ERG8YMR220W 1356 nt7.15□□□□□ -1.26
SHS1Q07657 TOD6YBL054W 1578 nt7.15□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 DOT1YDR440W 1749 nt7.14□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 OM45YIL136W 1182 nt7.14□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt7.14□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 TSR2YLR435W 618 nt7.14□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 ERR1YOR393W 1314 nt7.14□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 ERR2YPL281C 1314 nt7.14□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 RTG2YGL252C 1767 nt7.13□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 YMR034CYMR034C 1305 nt7.12□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 ALR1YOL130W 2580 nt7.12□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 YCR041WYCR041W 333 nt7.12□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 YSC83YHR017W 1158 nt7.12□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 TMA46YOR091W 1038 nt7.12□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 MRPL23YOR150W 492 nt7.12□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 HED1YDR014W-A 489 nt7.11□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 IMD1YAR073W 1212 nt7.11□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 CUE4YML101C 354 nt7.11□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 HIS1YER055C 894 nt7.1□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 CBR1YIL043C 855 nt7.1□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 YKR045CYKR045C 552 nt7.1□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 MHT1YLL062C 975 nt7.1□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 YLR112WYLR112W 420 nt7.1□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 MAM3YOL060C 2121 nt7.1□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 CDC1YDR182W 1476 nt7.09□□□□□ -1.27
SHS1Q07657 CEM1YER061C 1329 nt7.08□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 GPD2YOL059W 1323 nt7.08□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 TUF1YOR187W 1314 nt7.08□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 OSW2YLR054C 2175 nt7.08□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 URH1YDR400W 1023 nt7.08□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 YNL092WYNL092W 1203 nt7.08□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 PAC2YER007W 1557 nt7.08□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 YDR187CYDR187C 519 nt7.07□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 SNT309YPR101W 528 nt7.07□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 COQ1YBR003W 1422 nt7.07□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 FYV1YDR024W 486 nt7.06□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 SNF4YGL115W 969 nt7.06□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 YRB2YIL063C 984 nt7.06□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 YBR027CYBR027C 333 nt7.06□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 AMN1YBR158W 1650 nt7.06□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 YHR020WYHR020W 2067 nt7.05□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 CHA1YCL064C 1083 nt7.05□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 YDL177CYDL177C 513 nt7.05□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 CUP2YGL166W 678 nt7.05□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 TFG2YGR005C 1203 nt7.05□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 ATP10YLR393W 840 nt7.05□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.04□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 YER137CYER137C 447 nt7.04□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 YLR463CYLR463C 552 nt7.04□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 YMR122CYMR122C 375 nt7.04□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 YHK8YHR048W 1545 nt7.04□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 MRPL28YDR462W 444 nt7.03□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 YOR012WYOR012W 414 nt7.03□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 TAE1YBR261C 699 nt7.03□□□□□ -1.28
SHS1Q07657 RRP9YPR137W 1722 nt7.02□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.02□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 YAR064WYAR064W 300 nt7.02□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 YML018CYML018C 1182 nt7.02□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 GCD11YER025W 1584 nt7.01□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 YNL190WYNL190W 615 nt7.01□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 YJL045WYJL045W 1905 nt7.01□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 CCT8YJL008C 1707 nt7.01□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 SLA2YNL243W 2907 nt7□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 PPM2YOL141W 2088 nt7□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 MET30YIL046W 1923 nt7□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 COX10YPL172C 1389 nt7□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 TDH2YJR009C 999 nt7□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 CTF19YPL018W 1110 nt7□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 MSP1YGR028W 1089 nt6.99□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 MTR3YGR158C 753 nt6.99□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 DID2YKR035W-A 615 nt6.99□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 SGF29YCL010C 780 nt6.99□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 UIP5YKR044W 1332 nt6.99□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 STT3YGL022W 2157 nt6.98□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 MIP1YOR330C 3765 nt6.98□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 AIM2YAL049C 741 nt6.98□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 YMR253CYMR253C 1245 nt6.98□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 MCH2YKL221W 1422 nt6.98□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 VMA3YEL027W 483 nt6.97□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 MSO1YNR049C 633 nt6.97□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 IRC11YOR013W 471 nt6.97□□□□□ -1.29
SHS1Q07657 DFR1YOR236W 636 nt6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.5 ms