Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 YEL023CYEL023C 2049 nt6.58□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 VBA5YKR105C 1749 nt6.58□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 MIP1YOR330C 3765 nt6.58□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 YLL066CYLL066C 3618 nt6.57□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 YLL058WYLL058W 1728 nt6.57□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 YCR061WYCR061W 1896 nt6.57□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 TRR1YDR353W 960 nt6.56□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 URH1YDR400W 1023 nt6.56□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 RPL31BYLR406C 342 nt6.56□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 SSC1YJR045C 1965 nt6.56□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 GUT1YHL032C 2130 nt6.56□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 MRPS28YDR337W 861 nt6.55□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 CBR1YIL043C 855 nt6.55□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 COX16YJL003W 357 nt6.55□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 YOR268CYOR268C 399 nt6.55□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 ACO1YLR304C 2337 nt6.54□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 YPL247CYPL247C 1572 nt6.54□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 PPH22YDL188C 1134 nt6.54□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 YLR162WYLR162W 357 nt6.54□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 MET8YBR213W 825 nt6.54□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 PTC7YHR076W 1032 nt6.53□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 RPR1RPR1 369 nt6.53□□□□□ -1.36
YHC1Q05900 CMK2YOL016C 1344 nt6.52□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 YSC83YHR017W 1158 nt6.52□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 PRE5YMR314W 705 nt6.52□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 STF1YDL130W-A 261 nt6.51□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 YDL177CYDL177C 513 nt6.51□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.51□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 LAT1YNL071W 1449 nt6.5□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 YGL102CYGL102C 429 nt6.5□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 PRI1YIR008C 1230 nt6.5□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 MEU1YLR017W 1014 nt6.5□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 OPI11YPR044C 354 nt6.5□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 SMK1YPR054W 1167 nt6.5□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 SMX3YPR182W 261 nt6.5□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 ICP55YER078C 1536 nt6.5□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 VTS1YOR359W 1572 nt6.49□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 PEX31YGR004W 1389 nt6.49□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 YOX1YML027W 1158 nt6.49□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 IRC11YOR013W 471 nt6.49□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 RPL5YPL131W 894 nt6.49□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 YMR034CYMR034C 1305 nt6.49□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 OPI8YKR035C 642 nt6.48□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 SML1YML058W 315 nt6.48□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 RRN10YBL025W 438 nt6.48□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 AGP2YBR132C 1791 nt6.47□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 MSC3YLR219W 2187 nt6.47□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 YJL163CYJL163C 1668 nt6.47□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 ZIM17YNL310C 525 nt6.47□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 FIT2YOR382W 462 nt6.47□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 FCY22YER060W-A 1593 nt6.47□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 MFG1YDL233W 1377 nt6.46□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 HEL1YKR017C 1656 nt6.46□□□□□ -1.37
YHC1Q05900 NUP49YGL172W 1419 nt6.46□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 DYS1YHR068W 1164 nt6.46□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 AIM46YHR199C 933 nt6.46□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 ECM27YJR106W 2178 nt6.46□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 SEC62YPL094C 825 nt6.46□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 YHR020WYHR020W 2067 nt6.46□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 GCN3YKR026C 918 nt6.45□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 ERG10YPL028W 1197 nt6.45□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 TOS2YGR221C 1869 nt6.45□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 BDF2YDL070W 1917 nt6.44□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 ECM38YLR299W 1983 nt6.44□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 HIS1YER055C 894 nt6.44□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 YLL056CYLL056C 897 nt6.44□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 STT3YGL022W 2157 nt6.44□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 PAB1YER165W 1734 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 HSP12YFL014W 330 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 TOS6YNL300W 309 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 YOL046CYOL046C 675 nt6.43□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 DOT1YDR440W 1749 nt6.42□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 TMA46YOR091W 1038 nt6.42□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 HOG1YLR113W 1308 nt6.42□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 ARP3YJR065C 1350 nt6.42□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 HED1YDR014W-A 489 nt6.41□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 YJR107WYJR107W 987 nt6.41□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 ECM30YLR436C 3825 nt6.41□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 SUR7YML052W 909 nt6.41□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 MRPL19YNL185C 477 nt6.41□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 DFR1YOR236W 636 nt6.41□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 COQ1YBR003W 1422 nt6.41□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 HSM3YBR272C 1443 nt6.41□□□□□ -1.38
YHC1Q05900 YPR204WYPR204W 3099 nt6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.4 ms