Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Fmn1Q05860 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Fmn1Q05860 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Fmn1Q05860 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Fmn1Q05860 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Fmn1Q05860 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Fmn1Q05860 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Fmn1Q05860 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Fmn1Q05860 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Fmn1Q05860 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Fmn1Q05860 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Fmn1Q05860 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Fmn1Q05860 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Fmn1Q05860 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Fmn1Q05860 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Fmn1Q05860 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Fmn1Q05860 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Fmn1Q05860 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Fmn1Q05860 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Fmn1Q05860 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Fmn1Q05860 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Fmn1Q05860 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Fmn1Q05860 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Fmn1Q05860 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Fmn1Q05860 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141 ms