Protein–RNA interactions for Protein: Q04511

UFO1, Ubiquitin ligase complex F-box protein UFO1, yeastyeast

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFO1Q04511 YLR162WYLR162W 357 nt7.21□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 NTG2YOL043C 1143 nt7.21□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 APE4YHR113W 1473 nt7.2□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 YNR005CYNR005C 405 nt7.2□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 HXT13YEL069C 1695 nt7.19□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 DAL7YIR031C 1665 nt7.19□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 AMN1YBR158W 1650 nt7.19□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 NMD5YJR132W 3147 nt7.19□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 AIM46YHR199C 933 nt7.19□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 YJL144WYJL144W 315 nt7.19□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 YOL099CYOL099C 492 nt7.19□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 MRPL28YDR462W 444 nt7.18□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 HHY1YEL059W 309 nt7.18□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 YIP4YGL198W 708 nt7.18□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 MTR3YGR158C 753 nt7.18□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 MGM101YJR144W 810 nt7.18□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 MSB3YNL293W 1902 nt7.18□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 REC107YJR021C 945 nt7.17□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 URA1YKL216W 945 nt7.17□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 ZIM17YNL310C 525 nt7.17□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 YLL058WYLL058W 1728 nt7.17□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 YNL040WYNL040W 1371 nt7.17□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 ERS1YCR075C 783 nt7.16□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 SPG5YMR191W 1122 nt7.16□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 MCH2YKL221W 1422 nt7.16□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 YNL165WYNL165W 1221 nt7.15□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 TUF1YOR187W 1314 nt7.15□□□□□ -1.26
UFO1Q04511 YCR061WYCR061W 1896 nt7.15□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 FCP1YMR277W 2199 nt7.15□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.14□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 SML1YML058W 315 nt7.14□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 ARC35YNR035C 1029 nt7.14□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 CMK2YOL016C 1344 nt7.14□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 VBA5YKR105C 1749 nt7.13□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 PAC2YER007W 1557 nt7.13□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 SRF1YDL133W 1314 nt7.13□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 TRS31YDR472W 852 nt7.13□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 RPL31BYLR406C 342 nt7.13□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 MCP1YOR228C 909 nt7.13□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 CCT3YJL014W 1605 nt7.12□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 PUS4YNL292W 1212 nt7.12□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 CYB2YML054C 1776 nt7.12□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 YJL163CYJL163C 1668 nt7.12□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 TAH11YJR046W 1815 nt7.11□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 GPH1YPR160W 2709 nt7.11□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 EFM1YHL039W 1758 nt7.11□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 ASN2YGR124W 1719 nt7.11□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 PTC7YHR076W 1032 nt7.11□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 CBR1YIL043C 855 nt7.11□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 DPH5YLR172C 903 nt7.11□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 HBN1YCL026C-B 582 nt7.11□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 SEC23YPR181C 2307 nt7.11□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 RMA1YKL132C 1293 nt7.1□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 IDP3YNL009W 1263 nt7.1□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 ATG22YCL038C 1587 nt7.1□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 GSH1YJL101C 2037 nt7.1□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 KIN1YDR122W 3195 nt7.1□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 NTG1YAL015C 1200 nt7.09□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 FIT2YOR382W 462 nt7.09□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 YBR241CYBR241C 1467 nt7.09□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 PPS1YBR276C 2424 nt7.09□□□□□ -1.27
UFO1Q04511 MRPS28YDR337W 861 nt7.08□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 BUR6YER159C 429 nt7.08□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 RGD2YFL047W 2145 nt7.08□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 YGL102CYGL102C 429 nt7.08□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.08□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.08□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.08□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.08□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 SWP1YMR149W 861 nt7.08□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 SLA2YNL243W 2907 nt7.08□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 ICP55YER078C 1536 nt7.07□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 PRI1YIR008C 1230 nt7.07□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 YOL046CYOL046C 675 nt7.07□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 ERG10YPL028W 1197 nt7.07□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 SMX3YPR182W 261 nt7.07□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 YOS9YDR057W 1629 nt7.07□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 MSC3YLR219W 2187 nt7.06□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 YSC83YHR017W 1158 nt7.06□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 LGE1YPL055C 999 nt7.06□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 NUP49YGL172W 1419 nt7.06□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 RPL2BYIL018W 765 nt7.05□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 YNR014WYNR014W 639 nt7.05□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 SPE3YPR069C 882 nt7.05□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 AGX1YFL030W 1158 nt7.04□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 SEC62YPL094C 825 nt7.04□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 CDC13YDL220C 2775 nt7.04□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 BIO3YNR058W 1443 nt7.03□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.03□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 YLL056CYLL056C 897 nt7.03□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 LDB7YBL006C 543 nt7.03□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 YPR076WYPR076W 375 nt7.03□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 MPH3YJR160C 1809 nt7.03□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 MLS1YNL117W 1665 nt7.03□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 YMR034CYMR034C 1305 nt7.02□□□□□ -1.28
UFO1Q04511 YDL177CYDL177C 513 nt7.02□□□□□ -1.29
UFO1Q04511 AAD14YNL331C 1131 nt7.02□□□□□ -1.29
UFO1Q04511 YOR111WYOR111W 699 nt7.02□□□□□ -1.29
UFO1Q04511 HMT1YBR034C 1047 nt7.01□□□□□ -1.29
UFO1Q04511 MIP1YOR330C 3765 nt7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.3 ms