Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 CYS3YAL012W 1185 nt5.57□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 RRN10YBL025W 438 nt5.57□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 SPG5YMR191W 1122 nt5.57□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 MBF1YOR298C-A 456 nt5.57□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 ICL2YPR006C 1728 nt5.57□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 BRN1YBL097W 2265 nt5.56□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 NAF1YNL124W 1479 nt5.56□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 PDA1YER178W 1263 nt5.55□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 VBA5YKR105C 1749 nt5.54□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 PPH22YDL188C 1134 nt5.54□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 COX16YJL003W 357 nt5.54□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 NTG2YOL043C 1143 nt5.54□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 OPI11YPR044C 354 nt5.54□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 YPR130CYPR130C 408 nt5.54□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 OPI8YKR035C 642 nt5.53□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 GET4YOR164C 939 nt5.53□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 PEX31YGR004W 1389 nt5.53□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 YIP4YGL198W 708 nt5.52□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 YSC83YHR017W 1158 nt5.52□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 REC107YJR021C 945 nt5.52□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 snR30snR30 606 nt5.52□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 ECM38YLR299W 1983 nt5.52□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 BDF2YDL070W 1917 nt5.52□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 APE4YHR113W 1473 nt5.51□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 HEL1YKR017C 1656 nt5.51□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 RSP5YER125W 2430 nt5.51□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 RPL31BYLR406C 342 nt5.51□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 HTZ1YOL012C 405 nt5.51□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 MCP1YOR228C 909 nt5.51□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 RPL5YPL131W 894 nt5.51□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 YCL049CYCL049C 939 nt5.51□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 ARP3YJR065C 1350 nt5.51□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 YLL058WYLL058W 1728 nt5.51□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 ECM27YJR106W 2178 nt5.5□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 EDC3YEL015W 1656 nt5.5□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 CIA1YDR267C 993 nt5.5□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 URH1YDR400W 1023 nt5.5□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.5□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 CBR1YIL043C 855 nt5.5□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 MRPS28YDR337W 861 nt5.49□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 DYS1YHR068W 1164 nt5.49□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 YLR162WYLR162W 357 nt5.49□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 AAD14YNL331C 1131 nt5.49□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 YNR005CYNR005C 405 nt5.49□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 YPR204WYPR204W 3099 nt5.49□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 FCY22YER060W-A 1593 nt5.49□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 HSP12YFL014W 330 nt5.48□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 SUR7YML052W 909 nt5.48□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 ZIM17YNL310C 525 nt5.48□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 IRC11YOR013W 471 nt5.48□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 LGE1YPL055C 999 nt5.48□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 SPE3YPR069C 882 nt5.48□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 SMC5YOL034W 3282 nt5.48□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 YDL177CYDL177C 513 nt5.47□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 HIS1YER055C 894 nt5.47□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 PTC7YHR076W 1032 nt5.47□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 YCR061WYCR061W 1896 nt5.47□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 SKY1YMR216C 2229 nt5.47□□□□□ -1.53
YHP1Q04116 YJL144WYJL144W 315 nt5.46□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 GCN3YKR026C 918 nt5.46□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 SML1YML058W 315 nt5.46□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 YMR034CYMR034C 1305 nt5.46□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 CTF8YHR191C 402 nt5.45□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.44□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 PRI1YIR008C 1230 nt5.43□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 YKR032WYKR032W 315 nt5.43□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 TOS6YNL300W 309 nt5.43□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 DFR1YOR236W 636 nt5.43□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 STT3YGL022W 2157 nt5.43□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 PLB3YOL011W 2061 nt5.43□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 YJR107WYJR107W 987 nt5.42□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 PUS4YNL292W 1212 nt5.42□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 YHR020WYHR020W 2067 nt5.42□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 SKI2YLR398C 3864 nt5.42□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 ARG81YML099C 2643 nt5.42□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 MLS1YNL117W 1665 nt5.41□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 HEM2YGL040C 1029 nt5.41□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 ERG10YPL028W 1197 nt5.41□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 SMX3YPR182W 261 nt5.41□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 YBR113WYBR113W 483 nt5.41□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 HEM1YDR232W 1647 nt5.41□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 YJL163CYJL163C 1668 nt5.4□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 ICP55YER078C 1536 nt5.4□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 YDR415CYDR415C 1125 nt5.4□□□□□ -1.54
YHP1Q04116 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.6 ms