Protein–RNA interactions for Protein: P38915

SPT8, Transcription factor SPT8, yeastyeast

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT8P38915 TRR2YHR106W 1029 nt7.53□□□□□ -1.2
SPT8P38915 HTZ1YOL012C 405 nt7.53□□□□□ -1.2
SPT8P38915 AGP2YBR132C 1791 nt7.53□□□□□ -1.2
SPT8P38915 YPL247CYPL247C 1572 nt7.52□□□□□ -1.21
SPT8P38915 ERS1YCR075C 783 nt7.52□□□□□ -1.21
SPT8P38915 CIA1YDR267C 993 nt7.52□□□□□ -1.21
SPT8P38915 SPG5YMR191W 1122 nt7.52□□□□□ -1.21
SPT8P38915 PAC2YER007W 1557 nt7.51□□□□□ -1.21
SPT8P38915 YIP4YGL198W 708 nt7.51□□□□□ -1.21
SPT8P38915 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.51□□□□□ -1.21
SPT8P38915 VBA5YKR105C 1749 nt7.51□□□□□ -1.21
SPT8P38915 SMC5YOL034W 3282 nt7.5□□□□□ -1.21
SPT8P38915 YNR005CYNR005C 405 nt7.5□□□□□ -1.21
SPT8P38915 YOL099CYOL099C 492 nt7.5□□□□□ -1.21
SPT8P38915 MIP1YOR330C 3765 nt7.5□□□□□ -1.21
SPT8P38915 HEL1YKR017C 1656 nt7.5□□□□□ -1.21
SPT8P38915 TUF1YOR187W 1314 nt7.5□□□□□ -1.21
SPT8P38915 RPR1RPR1 369 nt7.49□□□□□ -1.21
SPT8P38915 RPL2BYIL018W 765 nt7.48□□□□□ -1.21
SPT8P38915 REC107YJR021C 945 nt7.48□□□□□ -1.21
SPT8P38915 YLL058WYLL058W 1728 nt7.48□□□□□ -1.21
SPT8P38915 RSP5YER125W 2430 nt7.47□□□□□ -1.21
SPT8P38915 LAT1YNL071W 1449 nt7.47□□□□□ -1.21
SPT8P38915 YNR014WYNR014W 639 nt7.47□□□□□ -1.21
SPT8P38915 ACO1YLR304C 2337 nt7.47□□□□□ -1.21
SPT8P38915 YBR241CYBR241C 1467 nt7.47□□□□□ -1.21
SPT8P38915 RGD2YFL047W 2145 nt7.46□□□□□ -1.21
SPT8P38915 VTS1YOR359W 1572 nt7.46□□□□□ -1.21
SPT8P38915 SKY1YMR216C 2229 nt7.46□□□□□ -1.22
SPT8P38915 MRPS28YDR337W 861 nt7.46□□□□□ -1.22
SPT8P38915 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.46□□□□□ -1.22
SPT8P38915 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.46□□□□□ -1.22
SPT8P38915 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.46□□□□□ -1.22
SPT8P38915 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.46□□□□□ -1.22
SPT8P38915 YLL066CYLL066C 3618 nt7.46□□□□□ -1.22
SPT8P38915 YLR162WYLR162W 357 nt7.45□□□□□ -1.22
SPT8P38915 ERG12YMR208W 1332 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT8P38915 PTC7YHR076W 1032 nt7.43□□□□□ -1.22
SPT8P38915 RPL31BYLR406C 342 nt7.43□□□□□ -1.22
SPT8P38915 EMP65YER140W 1671 nt7.43□□□□□ -1.22
SPT8P38915 CLN1YMR199W 1641 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT8P38915 PPH22YDL188C 1134 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT8P38915 YSC83YHR017W 1158 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT8P38915 YOX1YML027W 1158 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT8P38915 SML1YML058W 315 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT8P38915 OPI11YPR044C 354 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT8P38915 URH1YDR400W 1023 nt7.41□□□□□ -1.22
SPT8P38915 CBR1YIL043C 855 nt7.41□□□□□ -1.22
SPT8P38915 COS10YNR075W 1125 nt7.41□□□□□ -1.22
SPT8P38915 PRI1YIR008C 1230 nt7.4□□□□□ -1.22
SPT8P38915 COX16YJL003W 357 nt7.4□□□□□ -1.22
SPT8P38915 FIT2YOR382W 462 nt7.4□□□□□ -1.22
SPT8P38915 ECM38YLR299W 1983 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT8P38915 YJL163CYJL163C 1668 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT8P38915 ARP3YJR065C 1350 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT8P38915 YDL177CYDL177C 513 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT8P38915 ZIM17YNL310C 525 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT8P38915 UBP13YBL067C 2244 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT8P38915 BDF2YDL070W 1917 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT8P38915 YMR034CYMR034C 1305 nt7.38□□□□□ -1.23
SPT8P38915 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.38□□□□□ -1.23
SPT8P38915 YGL102CYGL102C 429 nt7.38□□□□□ -1.23
SPT8P38915 CTF8YHR191C 402 nt7.38□□□□□ -1.23
SPT8P38915 ICP55YER078C 1536 nt7.37□□□□□ -1.23
SPT8P38915 ECM30YLR436C 3825 nt7.37□□□□□ -1.23
SPT8P38915 DPH5YLR172C 903 nt7.37□□□□□ -1.23
SPT8P38915 SMX3YPR182W 261 nt7.37□□□□□ -1.23
SPT8P38915 NUP49YGL172W 1419 nt7.36□□□□□ -1.23
SPT8P38915 SUR7YML052W 909 nt7.36□□□□□ -1.23
SPT8P38915 IRC11YOR013W 471 nt7.36□□□□□ -1.23
SPT8P38915 YOS9YDR057W 1629 nt7.36□□□□□ -1.23
SPT8P38915 MSC3YLR219W 2187 nt7.36□□□□□ -1.23
SPT8P38915 CIR2YOR356W 1896 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT8P38915 HSP12YFL014W 330 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT8P38915 AIM46YHR199C 933 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT8P38915 YOL046CYOL046C 675 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT8P38915 PEX31YGR004W 1389 nt7.34□□□□□ -1.23
SPT8P38915 NAS6YGR232W 687 nt7.34□□□□□ -1.23
SPT8P38915 OPI8YKR035C 642 nt7.34□□□□□ -1.23
SPT8P38915 ERG10YPL028W 1197 nt7.34□□□□□ -1.23
SPT8P38915 SEC62YPL094C 825 nt7.34□□□□□ -1.23
SPT8P38915 FCY22YER060W-A 1593 nt7.33□□□□□ -1.24
SPT8P38915 ASN2YGR124W 1719 nt7.33□□□□□ -1.24
SPT8P38915 YHR020WYHR020W 2067 nt7.33□□□□□ -1.24
SPT8P38915 FPR2YDR519W 408 nt7.33□□□□□ -1.24
SPT8P38915 HIS1YER055C 894 nt7.33□□□□□ -1.24
SPT8P38915 GCN3YKR026C 918 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT8P38915 YLL056CYLL056C 897 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT8P38915 RPL5YPL131W 894 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT8P38915 HAL5YJL165C 2568 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT8P38915 YCR061WYCR061W 1896 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT8P38915 YEN1YER041W 2280 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT8P38915 GLN3YER040W 2193 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT8P38915 STT3YGL022W 2157 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT8P38915 SWD1YAR003W 1281 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT8P38915 TMA46YOR091W 1038 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT8P38915 MCP1YOR228C 909 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT8P38915 DFR1YOR236W 636 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT8P38915 COX15YER141W 1461 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT8P38915 YPR076WYPR076W 375 nt7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 200.6 ms