Protein–RNA interactions for Protein: P38842

YHR140W, UPF0641 membrane protein YHR140W, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WP38842 OPI8YKR035C 642 nt5.32□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 RTC4YNL254C 1206 nt5.32□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 YOR300WYOR300W 309 nt5.32□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 NOG2YNR053C 1461 nt5.32□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 TKL2YBR117C 2046 nt5.31□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 SGV1YPR161C 1974 nt5.31□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 MPA43YNL249C 1629 nt5.31□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 PAC2YER007W 1557 nt5.31□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 YPL247CYPL247C 1572 nt5.31□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 CTF8YHR191C 402 nt5.31□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 PUP1YOR157C 786 nt5.31□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 BDF2YDL070W 1917 nt5.31□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 SLX5YDL013W 1860 nt5.3□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 YCR049CYCR049C 447 nt5.3□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 MRP1YDR347W 966 nt5.3□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 YPQ2YDR352W 954 nt5.3□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 ADE1YAR015W 921 nt5.3□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 YML122CYML122C 381 nt5.3□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 GLN3YER040W 2193 nt5.3□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 SLA2YNL243W 2907 nt5.3□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 HXT15YDL245C 1704 nt5.29□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 HXT16YJR158W 1704 nt5.29□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 HSP12YFL014W 330 nt5.29□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 YHC3YJL059W 1227 nt5.29□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 MKK1YOR231W 1527 nt5.28□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 ECM38YLR299W 1983 nt5.28□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 RGD2YFL047W 2145 nt5.28□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 RPL5YPL131W 894 nt5.28□□□□□ -1.56
YHR140WP38842 MPE1YKL059C 1326 nt5.27□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 TUB1YML085C 1344 nt5.27□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 NFS1YCL017C 1494 nt5.27□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 GCN3YKR026C 918 nt5.27□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 HXT2YMR011W 1626 nt5.26□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 TRS31YDR472W 852 nt5.26□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.26□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 HIS1YER055C 894 nt5.25□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 YJL144WYJL144W 315 nt5.25□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 CUE4YML101C 354 nt5.25□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 NTE1YML059C 5040 nt5.24□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 YNL200CYNL200C 741 nt5.24□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 FCY22YER060W-A 1593 nt5.24□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 GFA1YKL104C 2154 nt5.23□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 AVT4YNL101W 2142 nt5.23□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 NCA3YJL116C 1014 nt5.23□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 PEX31YGR004W 1389 nt5.23□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 TOS1YBR162C 1368 nt5.23□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 YBR284WYBR284W 2394 nt5.22□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 YDL177CYDL177C 513 nt5.22□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 DOC1YGL240W 753 nt5.22□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 YKR032WYKR032W 315 nt5.22□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 EHD3YDR036C 1503 nt5.22□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 YMR034CYMR034C 1305 nt5.22□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 HDA1YNL021W 2121 nt5.21□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 YKR023WYKR023W 1593 nt5.21□□□□□ -1.57
YHR140WP38842 BRN1YBL097W 2265 nt5.21□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 URH1YDR400W 1023 nt5.21□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 FZF1YGL254W 900 nt5.21□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 YJR154WYJR154W 1041 nt5.21□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 YFR006WYFR006W 1608 nt5.21□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 PET494YNR045W 1470 nt5.2□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 PLB2YMR006C 2121 nt5.2□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 DYS1YHR068W 1164 nt5.2□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 YIA6YIL006W 1122 nt5.2□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 FUS3YBL016W 1062 nt5.2□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 GET4YOR164C 939 nt5.2□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 ADH5YBR145W 1056 nt5.2□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 ATF1YOR377W 1578 nt5.2□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 CEF1YMR213W 1773 nt5.19□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 PTC7YHR076W 1032 nt5.19□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 YJR107WYJR107W 987 nt5.19□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 SPG5YMR191W 1122 nt5.19□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 ATP23YNR020C 813 nt5.19□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 DML1YMR211W 1428 nt5.19□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 PHO3YBR092C 1404 nt5.19□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 HIS7YBR248C 1659 nt5.18□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 CYC8YBR112C 2901 nt5.18□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 YDR415CYDR415C 1125 nt5.18□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.18□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 YSC83YHR017W 1158 nt5.18□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 NTG2YOL043C 1143 nt5.18□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 HXT17YNR072W 1695 nt5.18□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 REC107YJR021C 945 nt5.17□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 TOS6YNL300W 309 nt5.17□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 IRC11YOR013W 471 nt5.17□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 ATP4YPL078C 735 nt5.17□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 HXK2YGL253W 1461 nt5.17□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 KNS1YLL019C 2214 nt5.16□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 NSE5YML023C 1671 nt5.16□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 CBR1YIL043C 855 nt5.16□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt5.16□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 SKI2YLR398C 3864 nt5.16□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 MIP1YOR330C 3765 nt5.16□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 NAF1YNL124W 1479 nt5.15□□□□□ -1.58
YHR140WP38842 MRPS28YDR337W 861 nt5.15□□□□□ -1.59
YHR140WP38842 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt5.15□□□□□ -1.59
YHR140WP38842 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt5.15□□□□□ -1.59
YHR140WP38842 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt5.15□□□□□ -1.59
YHR140WP38842 SUP51tL(UAA)J 84 nt5.15□□□□□ -1.59
YHR140WP38842 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt5.15□□□□□ -1.59
YHR140WP38842 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.9 ms