Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt2E9PUL5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrt2E9PUL5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrt2E9PUL5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrt2E9PUL5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms