Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARGC1BQ86YN6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms