Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PPARGC1BQ86YN6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPARGC1BQ86YN6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms