Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TK1P04183 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TK1P04183 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TK1P04183 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TK1P04183 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TK1P04183 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TK1P04183 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TK1P04183 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TK1P04183 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TK1P04183 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TK1P04183 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TK1P04183 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TK1P04183 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TK1P04183 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TK1P04183 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TK1P04183 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TK1P04183 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TK1P04183 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TK1P04183 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TK1P04183 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TK1P04183 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TK1P04183 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TK1P04183 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TK1P04183 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TK1P04183 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TK1P04183 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TK1P04183 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TK1P04183 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TK1P04183 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms