Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPARGC1BQ86YN6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms