Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRIP3Q6Q6R5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms